Entinostat and NHS-IL12 in aPD1/aPDL1 refractory models
收藏资源简介:
The three dataset files here are: var_ccbr1144_Metadata.rds Sample metadata table describing samples, group assignments, batch information, and plot labels. var_msigdb_v6_2_with_orthologs.rds MSigDB v6 database, with orthologs from Mouse and Macaca used in GSEA Preranked analyses. var_counts_matrix.rds Raw counts (RSEM) for RNAseq analysis. These data can be used with the docker and code found at this GitHub link: https://github.com/NIDAP-Community/Entinostat-and-NHS-IL12-in-aPD1-aPDL1-refractory-models
本次提供的三个数据集文件如下: 1. var_ccbr1144_Metadata.rds:样本元数据表,用于记录样本信息、分组归属、批次信息及绘图标签。 2. var_msigdb_v6_2_with_orthologs.rds:搭载小鼠与猕猴同源基因的分子特征数据库(MSigDB)v6.2版本,可用于GSEA预排名分析。 3. var_counts_matrix.rds:用于RNA测序(RNAseq)分析的原始计数矩阵(RSEM估算)。 上述数据集可配合该GitHub链接(https://github.com/NIDAP-Community/Entinostat-and-NHS-IL12-in-aPD1-aPDL1-refractory-models)中提供的Docker容器与代码进行使用。



