SARS-CoV-2 Sequenzdaten aus Deutschland

Für die Planung von Maßnahmen zur Eindämmung von COVID-19 kommt der genauen Kenntnis der Eigenschaften von SARS-CoV-2 eine zentrale Bedeutung zu. Eine besondere Rolle spielen in diesem Zusammenhang Mutationen des Virus. Für eine erfolgreiche Eindämmung der Pandemie ist es daher entscheidend, einen detaillierten Überblick über die Ausbreitungsmuster spezifischer SARS-CoV-2-Mutationen zu erhalten und auch neue Mutation frühzeitig zu entdecken.<br>Hierfür stellt das Robert Koch-Institut die Systeme zur bundesweiten molekularen Surveillance bereit. Jedes Labor in Deutschland, das SARS-CoV-2 sequenziert, ist laut der Verordnung zur molekulargenetischen Surveillance des Coronavirus SARS-CoV-2 verpflichtet, dem Robert Koch-Institut die Sequenz- und zugehörige Metadaten zu übermitteln. Technisch erfolgt diese Übermittlung über den Deutschen Elektronischen Sequenzdaten-Hub (DESH).<br>Im Projekt "OSEDA - Offene Sequenzdaten" verpflichtet sich das RKI, die aufgearbeiteten und qualitätskontrollierten Sequenzdaten zusammen mit einer Auswahl von klinisch-epidemiologischen Daten über die öffentlich zugängliche Repositorien des European Nucleotide Archive) und GISAID für weitere Forschungsvorhaben bereitzustellen.在规划新型冠状病毒肺炎（COVID-19）防控措施时，精准掌握新冠病毒（SARS-CoV-2）的各项特性具有核心意义。在此背景下，病毒的突变发挥着尤为关键的作用。因此，若要成功遏制此次新冠疫情大流行，关键在于全面掌握特定新冠病毒（SARS-CoV-2）突变株的传播模式，并能够及早发现新型突变毒株。 为此，罗伯特·科赫研究所（Robert Koch-Institut，以下简称RKI）搭建了覆盖全德国的分子遗传学监测系统。根据《新冠病毒（SARS-CoV-2）分子遗传学监测条例》，德国境内所有完成新冠病毒测序的实验室，均有义务向罗伯特·科赫研究所提交测序数据及相关元数据。该数据提交的技术实现依托于德国电子测序数据中心（Deutschen Elektronischen Sequenzdaten-Hub，DESH）。 在“OSEDA——开放测序数据”项目中，罗伯特·科赫研究所承诺，将通过欧洲核苷酸档案馆（European Nucleotide Archive，ENA）与全球共享所有流感数据倡议（Global Initiative on Sharing All Influenza Data，GISAID）的公共可访问存储库，对外发布经过整理优化与质量管控的测序数据，以及经筛选的临床流行病学数据，以供后续科研工作使用。