CAT 4.6 taxonomic binning of the CAMI 2 Mouse Gut Toy data set, gold standard pooled assembly

Mendeley Data2024-03-27 更新2024-06-27 收录

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Taxonomic binning of the gold standard pooled assembly Software: CAT SoftwareVersion: 4.6 DataURL: https://data.cami-challenge.org/participate SoftwareURL: https://github.com/dutilh/CAT ReferenceDatabase: prebuilt 2018-12-12 Taxonomy: NCBI 2018-12-12 ShortReadsUsed: False LongReadsUsed: False CommandUsed: CAT contigs -c anonymous_gsa_pooled.fasta -d CAT_prepare_20181212/2018-12-12_CAT_database/ -t CAT_prepare_20181212/2018-12-12_taxonomy/ --tmpdir tmp --nproc 16

金标准合并组装序列的分类分箱（taxonomic binning）分析软件：CAT 软件版本：4.6 数据获取地址：https://data.cami-challenge.org/participate 软件源码地址：https://github.com/dutilh/CAT 参考数据库：2018年12月12日预构建版本，分类系统采用NCBI 2018年12月12日版本是否使用短读长测序数据：否是否使用长读长测序数据：否执行命令：CAT contigs -c anonymous_gsa_pooled.fasta -d CAT_prepare_20181212/2018-12-12_CAT_database/ -t CAT_prepare_20181212/2018-12-12_taxonomy/ --tmpdir tmp --nproc 16

创建时间：

2023-06-28