Transcriptional profiling of cerebral cortex and striatum from a mouse model of Huntington's disease (Q140) crossed with Msh6 heterozygous and homozygous mice

Cerebral cortex and striatum were isolated from 6-month old Msh6+/- and Msh6-/- mice crossed with the Q140 knock-in (KI) HD mice and their respective controls. Transcriptomic analysis (RNASeq) was performed on 6 genotypes: WT, Q140, Msh6+/-, Q140 X Msh6+/-, Msh6-/-, and Q140 X Msh6-/-, 8 replicates per genotype. RNASeq analysis was performed on samples from the cerebral cortex and striatum tissues of 6 months old wild type, Q140, Msh6+/-, Q140 X Msh6+/-, Msh6-/-, and Q140 X Msh6-/- mice. N = 8 per group (4M/4F)

本数据集的样本取自与Q140敲入（KI, knock-in）亨廷顿病（HD, Huntington's disease）小鼠杂交的6月龄Msh6杂合子（Msh6+/-）、纯合子敲除（Msh6-/-）小鼠及其各自对照，从中分离大脑皮层与纹状体组织。针对6种基因型开展转录组测序（RNASeq）分析，涉及的基因型包括野生型（WT）、Q140、Msh6+/-、Q140×Msh6+/-、Msh6-/-以及Q140×Msh6-/-，每个基因型设置8个生物学重复，每组样本均包含4只雄性与4只雌性小鼠（每组n=8，4雄/4雌）。