PE-Positive Digital Subtraction CTPA with Annotations

This dataset is for pulmonary embolism diagnosis using non-contrast CT and CTPA. We provide high-quality, pixel-level annotations for emboli masks on both CTPA and non-contrast CT (registered from CTPA). Data Format All files are in numpy.float16 format, with a shape of [512, 512, 512]. Resolution: [334/512 mm, 334/512 mm, 1 mm] DICOM attribute: Image Orientation (Patient): [1, 0, 0, 0, 1, 0] Segmentation Format: Binary masks CT Intensity Scaling: CT_data * 1600 - 600 restores the original Hounsfield Unit (HU) values We also provide pulmonary artery-vein segmentations and emboli segmentations for the RSNA-PE Dataset. For the RSNA-PE Dataset, first convert DICOM to rescaled_CTPA using: 🔗 get_rescaled_ct.pyThen, normalize its Patient Orientation using: 🔗 normalize_direction.py Dataset Structure 📂 CT-CTPA-Paired_Dataset (200 cases)├── 📁 CTPA_Data│ ├── 📁 rescaled_CTPA│ ├── 📁 semantics│ ├── 📁 emboli_mask│ ├── 📁 airway_mask│ ├── 📁 artery_mask│ ├── 📁 vein_mask│ ├── 📁 blood_center_line│ ├── 📁 blood_branch_map ├── 📁 Non-Contrast_Data│ ├── 📁 rescaled_ct│ ├── 📁 semantics│ ├── 📁 emboli_mask│ ├── 📁 blood_vessel_lumen_mask│ ├── 📁 airway_mask│ ├── 📁 artery_mask│ ├── 📁 vein_mask│ ├── 📁 blood_center_line│ ├── 📁 blood_branch_map 📂 AV-Emboli_Seg_RSNA-PE-Dataset (7,222 cases)├── 📁 artery_mask├── 📁 emboli_mask├── 📁 vein_mask本数据集用于基于平扫CT（non-contrast CT）与CT肺动脉造影（CTPA）的肺栓塞（pulmonary embolism）诊断。 我们为CTPA与经CTPA配准得到的平扫CT提供了高质量的像素级栓子掩码标注。 数据格式 所有文件均采用numpy.float16格式，维度为[512, 512, 512]。 分辨率：[334/512 mm, 334/512 mm, 1 mm] DICOM属性：患者图像方位（Image Orientation (Patient)）：[1, 0, 0, 0, 1, 0] 分割掩码格式：二值掩码 CT强度缩放：通过CT_data × 1600 - 600即可还原原始亨氏单位（Hounsfield Unit, HU）值。 我们还为RSNA-PE数据集提供肺动静脉分割与栓子分割标注。 针对RSNA-PE数据集，需先通过脚本🔗get_rescaled_ct.py将DICOM文件转换为重缩放后的CTPA数据，随后通过脚本🔗normalize_direction.py完成患者方位归一化处理。 数据集结构 📂 CT-CTPA配对数据集（共200例） ├── 📁 CTPA数据 │ ├── 📁 重缩放CTPA数据 │ ├── 📁 语义标注 │ ├── 📁 栓子掩码 │ ├── 📁 气道掩码 │ ├── 📁 动脉掩码 │ ├── 📁 静脉掩码 │ ├── 📁 血管中心线 │ ├── 📁 血管分支映射图 ├── 📁 平扫CT数据 │ ├── 📁 重缩放平扫CT数据 │ ├── 📁 语义标注 │ ├── 📁 栓子掩码 │ ├── 📁 血管腔掩码 │ ├── 📁 气道掩码 │ ├── 📁 动脉掩码 │ ├── 📁 静脉掩码 │ ├── 📁 血管中心线 │ ├── 📁 血管分支映射图 📂 动静脉与栓子分割RSNA-PE数据集（共7222例） ├── 📁 动脉掩码 ├── 📁 栓子掩码 ├── 📁 静脉掩码