Amyloid-beta 16-22 peptide monomer simulation with the CHARMM-Drude force field and OpenMM (Run 1)

Amyloid-beta 16-22 peptide (monomer) simulations with the CHARMM-Drude force field and OpenMM. This is the first independent simulation runs out of 3. Part 1-2 are 200 ns long, 3-8 are 100 ns each. Total trajectory length is 1 microseconds. Frame saving frequency is 10 ps. The system contains ~ 150 mM NaCl.本数据集针对淀粉样β蛋白16-22肽（单体）的分子模拟，采用CHARMM-Drude力场（CHARMM-Drude force field）与OpenMM进行。该数据集为3组独立模拟中的第一组。其中第1至2组模拟时长为200纳秒（ns），第3至8组每组模拟时长为100纳秒（ns）。总模拟轨迹时长为1微秒（μs），轨迹帧保存频率为每10皮秒（ps）。模拟体系中含有约150毫摩尔每升（mM）的氯化钠（NaCl）。