Nucleic Acid Phylogenetic Profile

NAPP (Nucleic Acids Phylogenetic Profile) enables users to retrieve RNA-rich clusters from any genome in a list of 1000+ sequenced bacterial genomes. RNA-rich clusters can be viewed separately or, alternatively, all tiles from RNA-rich clusters can be contiged into larger elements and retrieved at once as a CSV or GFF file for use in a genome browser or comparison with other predictions/RNA-seq experiments.

NAPP（核酸系统发育谱，Nucleic Acids Phylogenetic Profile）可支持用户从包含1000余个已测序细菌基因组的列表中，检索任意目标基因组内的富含RNA的基因簇。此类基因簇既可单独查看，也可将这些簇对应的所有基因组区段拼接为更大的连续序列元件，随后以CSV或GFF格式批量导出，用于基因组浏览器可视化分析，或与其他预测结果、RNA测序（RNA-seq）实验数据进行比对分析。

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

NAPP（Nucleic Acids Phylogenetic Profile）数据集允许用户从1000多个已测序细菌基因组中检索RNA丰富的簇。这些簇可单独查看，或整合为更大的元素，并以CSV或GFF格式导出，用于基因组浏览器或与其他预测/RNA-seq实验比较。