Table 1 in Five new species of Trichoderma from moist soils in China

Table 1. Strain numbers and GenBank accession numbers of sequences used for phylogenetic analyses. SpeciesCladeStrainGenBank accession numbersITStef1 -αrpb2T. adaptatumVirideHMAS 248800-KX428024KX428042T. albofulvopsisVirideHMAS 273760-KU529127KU529138T. alutaceumPolysporumCBS 120535FJ860725FJ179567FJ179600T. appalachienseVirideGJS 97-243DQ315419DQ307503DQ307503T. atlanticumPolysporumCBS 120632FJ860781FJ860649FJ860546T. atrovirideVirideCBS 119499FJ860726FJ860611FJ860518T. bavaricumPolysporumCBS 120538FJ860737FJ860621FJ860527T. beijingenseVirideHMAS 248804-KX428025KX428043T. bifurcatumVirideHMAS 248795-KX428018KX428036T. caerulescensVirideS195JN715589JN715621JN715604T. composticolaVirideS590=CBS 133497-KC285631KC285754T. europaeumPolysporumS611-KJ665489KJ665268T. foliicolaPolysporumHypo 645JQ685871JQ685862JQ685876T. gamsiiVirideS488-JN715613KJ665270T. hailarenseVirideWT17901*= ACCC 39711MH287485MH287505MH287506T. hailarenseVirideWT17803MH606226MH606229MH606232T. hispanicumVirideS453=CBS 130540JN715595JN715659JN715600T. istrianumVirideS123-KJ665521KJ665280T. laevisporumVirideHMAS 273756-KU529128KU529139T. lacuwombatensePolysporumGJS 99-198-KJ665547KJ665286T. leucopusPolysporumCBS 122499FJ860764FJ179571FJ179605T. luteffusumPolysporumCBS 120537FJ860773FJ860645FJ860543T. macrofasciculatumPolysporumWT37805* = ACCC 39712MH287487MH287509MH287493T. macrofasciculatumPolysporumWT37810MH287488MH287510MH287494T. mediterraneumPolysporumS190-KJ665568KJ665296T. minutisporumPolysporumGJS 90-82-KJ665618KJ665316T. neokoningiiVirideCBS 120070=GJS 04-216DQ841734KJ665620KJ665318T. nordicumVirideWT13001* =ACCC 39713MH287483MH287501MH287502T. nordicumVirideWT61001MH287484MH287503MH287504T. nybergianumPolysporumCBS 122500FJ860791FJ179575FJ179611T. ochroleucumVirideCBS 119502FJ860793FJ860659FJ860556T. olivascensVirideS475=CBS 132574-KC285624KC285752T. pachypallidumPolysporumCBS 122126FJ860798FJ860662JQ685879T. palidulumVirideHMAS 275665-MG383493MG383487T. paratrovirideVirideCBS136489-KJ665627KJ665321T. paraviridescensVirideCBS 119321DQ677651DQ672610KC285763T. parapiluliferumPolysporumCBS 120921FJ860799FJ179578FJ179614T. piluliferumPolysporumCBS 120927FJ860810FJ860674FJ179615T. placentulaPolysporumCBS 120924-FJ179580FJ179616T. polysporumPolysporumCPK 3131-FJ860661FJ860558T. pruinosumPolysporumHMAS 247217-MF371227MF371212T. samuelsiiVirideS5=CBS 130537JN715593JN715651JN715599T. sempervirentisVirideS599=CBS 133498-KC285632KC285755T. seppoiPolysporumCBS 122498-FJ179581FJ179617T. shangrilaensePolysporumWT34004*= ACCC 39714MH287489MH287495MH287496T. shangrilaensePolysporumWT40502MH606224MH606227MH606230T. shaoguanicumVirideHMAS 248809-KX428031KX428049T. sinoluteumPolysporumHMAS 252868-KJ634777KJ634744T. speciosumVirideCGMCC 3.19079MH113929MH183184MH155270T. sphaerosporumVirideHMAS 273763-KU529134KU529145T. subvirideVirideHMAS 273761-KU529131KU529142T. tardumVirideHMAS 248798-KX428020KX428038T. trixiaeVirideATCC 32630DQ315445DQ307526KC285770T. vadicolaVirideWT10708*= ACCC 39716MH287491MH287499MH287511T. vadicolaVirideWT32801MH606225MH606228MH606231T. valdunenseVirideCBS 120923FJ860863FJ860717FJ860605T. vinosumVirideGJS 99-158=CBS 119087AY380904AY376047KC285779T. viridariumVirideS136=CBS 132568-KC285658KC285760T. virideVirideCBS 119327DQ677655DQ672617EU711362T. viridescensVirideS452=CBS 132573-KC285646KC285758T. viridialbumVirideS250=CBS 133495-KC285706KC285774T. virilenteVirideS281=CBS 132569-KC285692KC285767T. vulgatumVirideHMAS 248796-KX428019KX428037Protocrea illinoensisOutgroupTFC 96-98EU703930EU703905EU703952Protocrea farinosaOutgroupCPK 3144EU703917EU703894EU703938 Newly-sequenced material is indicated in bold type.表1 用于系统发育分析的序列对应的菌株编号及GenBank登录号 物种 演化支（Clade） 菌株 GenBank登录号（内转录间隔区（Internal Transcribed Spacer，ITS）、Stef1-α、rpb2） T. adaptatum 绿演化支（Viride） HMAS 248800 KX428024、KX428042 T. albofulvopsis 绿演化支（Viride） HMAS 273760 KU529127、KU529138 T. alutaceum 多孢演化支（Polysporum） CBS 120535 FJ860725、FJ179567、FJ179600 T. appalachiense 绿演化支（Viride） GJS 97-243 DQ315419、DQ307503、DQ307503 T. atlanticum 多孢演化支（Polysporum） CBS 120632 FJ860781、FJ860649、FJ860546 T. atroviride 绿演化支（Viride） CBS 119499 FJ860726、FJ860611、FJ860518 T. bavaricum 多孢演化支（Polysporum） CBS 120538 FJ860737、FJ860621、FJ860527 T. beijingense 绿演化支（Viride） HMAS 248804 KX428025、KX428043 T. bifurcatum 绿演化支（Viride） HMAS 248795 KX428018、KX428036 T. caerulescens 绿演化支（Viride） S195 JN715589、JN715621、JN715604 T. composticola 绿演化支（Viride） S590 = CBS 133497 KC285631、KC285754 T. europaeum 多孢演化支（Polysporum） S611 KJ665489、KJ665268 T. foliicola 多孢演化支（Polysporum） Hypo 645 JQ685871、JQ685862、JQ685876 T. gamsii 绿演化支（Viride） S488 JN715613、KJ665270 T. hailarense 绿演化支（Viride） WT17901* = ACCC 39711 MH287485、MH287505、MH287506 T. hailarense 绿演化支（Viride） WT17803 MH606226、MH606229、MH606232 T. hispanicum 绿演化支（Viride） S453 = CBS 130540 JN715595、JN715659、JN715600 T. istrianum 绿演化支（Viride） S123 KJ665521、KJ665280 T. laevisporum 绿演化支（Viride） HMAS 273756 KU529128、KU529139 T. lacuwombatense 多孢演化支（Polysporum） GJS 99-198 KJ665547、KJ665286 T. leucopus 多孢演化支（Polysporum） CBS 122499 FJ860764、FJ179571、FJ179605 T. luteffusum 多孢演化支（Polysporum） CBS 120537 FJ860773、FJ860645、FJ860543 T. macrofasciculatum 多孢演化支（Polysporum） WT37805* = ACCC 39712 MH287487、MH287509、MH287493 T. macrofasciculatum 多孢演化支（Polysporum） WT37810 MH287488、MH287510、MH287494 T. mediterraneum 多孢演化支（Polysporum） S190 KJ665568、KJ665296 T. minutisporum 多孢演化支（Polysporum） GJS 90-82 KJ665618、KJ665316 T. neokoningii 绿演化支（Viride） CBS 120070 = GJS 04-216 DQ841734、KJ665620、KJ665318 T. nordicum 绿演化支（Viride） WT13001* = ACCC 39713 MH287483、MH287501、MH287502 T. nordicum 绿演化支（Viride） WT61001 MH287484、MH287503、MH287504 T. nybergianum 多孢演化支（Polysporum） CBS 122500 FJ860791、FJ179575、FJ179611 T. ochroleucum 绿演化支（Viride） CBS 119502 FJ860793、FJ860659、FJ860556 T. olivascens 绿演化支（Viride） S475 = CBS 132574 KC285624、KC285752 T. pachypallidum 多孢演化支（Polysporum） CBS 122126 FJ860798、FJ860662、JQ685879 T. palidulum 绿演化支（Viride） HMAS 275665 MG383493、MG383487 T. paratroviride 绿演化支（Viride） CBS136489 KJ665627、KJ665321 T. paraviridescens 绿演化支（Viride） CBS 119321 DQ677651、DQ672610、KC285763 T. parapiluliferum 多孢演化支（Polysporum） CBS 120921 FJ860799、FJ179578、FJ179614 T. piluliferum 多孢演化支（Polysporum） CBS 120927 FJ860810、FJ860674、FJ179615 T. placentula 多孢演化支（Polysporum） CBS 120924 FJ179580、FJ179616 T. polysporum 多孢演化支（Polysporum） CPK 3131 FJ860661、FJ860558 T. pruinosum 多孢演化支（Polysporum） HMAS 247217 MF371227、MF371212 T. samuelsii 绿演化支（Viride） S5 = CBS 130537 JN715593、JN715651、JN715599 T. sempervirentis 绿演化支（Viride） S599 = CBS 133498 KC285632、KC285755 T. seppoi 多孢演化支（Polysporum） CBS 122498 FJ179581、FJ179617 T. shangrilaense 多孢演化支（Polysporum） WT34004* = ACCC 39714 MH287489、MH287495、MH287496 T. shangrilaense 多孢演化支（Polysporum） WT40502 MH606224、MH606227、MH606230 T. shaoguanicum 绿演化支（Viride） HMAS 248809 KX428031、KX428049 T. sinoluteum 多孢演化支（Polysporum） HMAS 252868 KJ634777、KJ634744 T. speciosum 绿演化支（Viride） CGMCC 3.19079 MH113929、MH183184、MH155270 T. sphaerosporum 绿演化支（Viride） HMAS 273763 KU529134、KU529145 T. subviride 绿演化支（Viride） HMAS 273761 KU529131、KU529142 T. tardum 绿演化支（Viride） HMAS 248798 KX428020、KX428038 T. trixiae 绿演化支（Viride） ATCC 32630 DQ315445、DQ307526、KC285770 T. vadicola 绿演化支（Viride） WT10708* = ACCC 39716 MH287491、MH287499、MH287511 T. vadicola 绿演化支（Viride） WT32801 MH606225、MH606228、MH606231 T. valdunense 绿演化支（Viride） CBS 120923 FJ860863、FJ860717、FJ860605 T. vinosum 绿演化支（Viride） GJS 99-158 = CBS 119087 AY380904、AY376047、KC285779 T. viridarium 绿演化支（Viride） S136 = CBS 132568 KC285658、KC285760 T. viride 绿演化支（Viride） CBS 119327 DQ677655、DQ672617、EU711362 T. viridescens 绿演化支（Viride） S452 = CBS 132573 KC285646、KC285758 T. viridialbum 绿演化支（Viride） S250 = CBS 133495 KC285706、KC285774 T. virilente 绿演化支（Viride） S281 = CBS 132569 KC285692、KC285767 T. vulgatum 绿演化支（Viride） HMAS 248796 KX428019、KX428037 Protocrea illinoensis 外类群（Outgroup） TFC 96-98 EU703930、EU703905、EU703952 Protocrea farinosa 外类群（Outgroup） CPK 3144 EU703917、EU703894、EU703938 新测序的材料以加粗字体标注。