Immune-epithelial-stromal networks define the cellular ecosystem of the small intestine in celiac disease

spatial_transcriptomics_zenodo.RDS - Seurat object RDS file with 10x Visium spatial transcriptomics dataset. gamma_delta.RDS - Seurat object RDS file with scRNA-Seq 10x dataset from gamma-delta and CD8+ T-Cells. BD_CD8.RDS - Seurat object RDS file with scRNA-Seq BD Rhapsody dataset from CD8+ T-Cells. BD_CD4.RDS - Seurat object RDS file with scRNA-Seq BD Rhapsody dataset from CD4+ T-Cells. BD_CD45.RDS - Seurat object RDS file with scRNA-Seq BD Rhapsody dataset from CD45+ Immune cells. single_cell_CD45.RDS - Seurat object RDS file with scRNA-Seq 10x dataset from CD45+ Immune cells. cd8.RDS - Seurat object RDS file with scRNA-Seq 10x dataset from CD8+ T-Cells. cd4.RDS - Seurat object RDS file with scRNA-Seq 10x dataset from CD4+ T-Cells. epi.RDS - Seurat object RDS file with scRNA-Seq 10x dataset from epithelial cells. eecs.RDS - Seurat object RDS file with scRNA-Seq 10x dataset from enteroendocrine cells.spatial_transcriptomics_zenodo.RDS —— 包含10x Visium空间转录组学数据集的Seurat对象RDS文件。 gamma_delta.RDS —— 来源于γδ T细胞与CD8+ T细胞的10x平台单细胞RNA测序（scRNA-Seq）数据集对应的Seurat对象RDS文件。 BD_CD8.RDS —— 来源于CD8+ T细胞的BD Rhapsody平台单细胞RNA测序数据集对应的Seurat对象RDS文件。 BD_CD4.RDS —— 来源于CD4+ T细胞的BD Rhapsody平台单细胞RNA测序数据集对应的Seurat对象RDS文件。 BD_CD45.RDS —— 来源于CD45+免疫细胞的BD Rhapsody平台单细胞RNA测序数据集对应的Seurat对象RDS文件。 single_cell_CD45.RDS —— 来源于CD45+免疫细胞的10x平台单细胞RNA测序数据集对应的Seurat对象RDS文件。 cd8.RDS —— 来源于CD8+ T细胞的10x平台单细胞RNA测序数据集对应的Seurat对象RDS文件。 cd4.RDS —— 来源于CD4+ T细胞的10x平台单细胞RNA测序数据集对应的Seurat对象RDS文件。 epi.RDS —— 来源于上皮细胞的10x平台单细胞RNA测序数据集对应的Seurat对象RDS文件。 eecs.RDS —— 来源于肠内分泌细胞的10x平台单细胞RNA测序数据集对应的Seurat对象RDS文件。