Additional file 1: Table S1. of CAP protein superfamily members in Toxocara canis

CAP protein-encoding genes of Toxocara canis. For each predicted protein, the genomic scaffolds to which they map, including the length of the inferred amino acid sequences and InterProScan matches (including domains, motifs and signal peptides), are shown. Table S2. Pairwise comparisons of 28 predicted Toxocara canis CAP protein sequences with homologs in Caenorhabditis elegans and parasitic nematodes including Ascaris lumbricoides (Al), Anisakis simplex (As), Ascaris suum (Asu), Brugia malayi (Bm), Caenorhabditis japonica (Cj), Caenorhabditis sinica (Cs), Dirofilaria immitis (Di), Dracunculus medinensis (Dm), Elaeophora elaphi (Ee), Enterobius vermicularis (Ev), Loa loa (Ll), Litomosoides sigmodontis (Ls), Oesophagostomum dentatum (Od), Onchocerca ochengi (Oo), Onchocerca volvulus (Ov), Parascaris equorum (Pe), Panagrellus redivivus (Pr), Steinernema carpocapsae (Sc), Steinernema feltiae (Sf), Steinernema glaseri (Sg), Syphacia muris (Sm), Steinernema monticolum (Smo), Steinernema scapterisci (Ss) and Thelazia callipaeda (Tc), with gene identification (ID) and identity (%) indicated in brackets. Table S3. Toxocara canis cap genes (Tc-cap) differentially transcribed (upregulated; log2-fold change: > 2) in individual life stages/sexes/tissues (pairwise comparisons). Table S4. Transcription of Toxocara canis cap genes (Tc-cap) in different life stages/sexes/tissues. Values are transcripts per million (TPM). (XLSX 44 kb)

犬弓首蛔虫（Toxocara canis）CAP蛋白编码基因。针对每一个预测得到的蛋白，本数据集展示了其锚定的基因组支架（genomic scaffolds）、推导的氨基酸序列长度以及InterProScan比对结果（包括结构域、基序与信号肽）。附表S2：28条预测得到的犬弓首蛔虫CAP蛋白序列，与秀丽隐杆线虫（Caenorhabditis elegans）及各类寄生线虫同源序列的两两比对结果。所涉及的寄生线虫包括人蛔虫（Ascaris lumbricoides，Al）、简单异尖线虫（Anisakis simplex，As）、猪蛔虫（Ascaris suum，Asu）、马来布鲁线虫（Brugia malayi，Bm）、日本隐杆线虫（Caenorhabditis japonica，Cj）、中华隐杆线虫（Caenorhabditis sinica，Cs）、犬恶丝虫（Dirofilaria immitis，Di）、麦地那龙线虫（Dracunculus medinensis，Dm）、鹿棘唇线虫（Elaeophora elaphi，Ee）、蠕形住肠线虫（Enterobius vermicularis，Ev）、罗阿罗阿线虫（Loa loa，Ll）、Sigmodont鼠住丝线虫（Litomosoides sigmodontis，Ls）、齿状食道口线虫（Oesophagostomum dentatum，Od）、Ochengi盘尾丝虫（Onchocerca ochengi，Oo）、旋盘尾丝虫（Onchocerca volvulus，Ov）、马副蛔虫（Parascaris equorum，Pe）、泛生潘革丽线虫（Panagrellus redivivus，Pr）、小卷蛾斯氏线虫（Steinernema carpocapsae，Sc）、夜蛾斯氏线虫（Steinernema feltiae，Sf）、格氏斯氏线虫（Steinernema glaseri，Sg）、鼠管状线虫（Syphacia muris，Sm）、山地斯氏线虫（Steinernema monticolum，Smo）、蟋蟀斯氏线虫（Steinernema scapterisci，Ss）以及结膜吸吮线虫（Thelazia callipaeda，Tc）；比对结果中，基因编号（ID）与序列相似度（%）以括号标注。附表S3：在不同生活史阶段、性别及组织中呈差异转录（上调；log2倍数变化>2）的犬弓首蛔虫cap基因（Tc-cap）的两两比对结果。附表S4：不同生活史阶段、性别及组织中犬弓首蛔虫cap基因（Tc-cap）的转录水平，数值以每百万转录本（transcripts per million，TPM）表示。（XLSX格式，大小44 KB）