Nicotiana sylvestris genome assembly and annotation
收藏NIAID Data Ecosystem2026-05-02 收录
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https://zenodo.org/record/8256251
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资源简介：
De novo genome assembly and annotation of Nicotiana sylvestris.
The following files are available:
nsyl.fa.gz: reference genome sequence in fasta format
nsyl.gff3.gz: gene annotation in GFF3 format
nsyl.gtf.gz: gene annotation in GTF format
nsyl.tx.fa.gz: transcript sequences in fasta format
nsyl.cds.fa.gz: coding sequences in fasta format
nsyl.prot.fa.gz: protein sequences in fasta format
nsyl.tsv.gz: gene functional annotation in TSV format
nsyl.rt.fa.gz: retrotransposon sequences in fasta format
nsyl.rt.gff3.gz: retrotransposon annotation on GFF3 format
nsyl.rt.tsv.gz: retrotransposon annotation in TSV format
nsyl.chr_to_id.tsv.gz: mapping of sequence names to ids in TSV format
林烟草（Nicotiana sylvestris）的从头基因组组装与注释。
本次数据集包含以下文件：
nsyl.fa.gz：FASTA格式的参考基因组序列
nsyl.gff3.gz：GFF3格式的基因注释文件
nsyl.gtf.gz：GTF格式的基因注释文件
nsyl.tx.fa.gz：FASTA格式的转录本序列
nsyl.cds.fa.gz：FASTA格式的编码序列（CDS）
nsyl.prot.fa.gz：FASTA格式的蛋白质序列
nsyl.tsv.gz：TSV格式的基因功能注释文件
nsyl.rt.fa.gz：FASTA格式的逆转录转座子序列
nsyl.rt.gff3.gz：GFF3格式的逆转录转座子注释文件
nsyl.rt.tsv.gz：TSV格式的逆转录转座子注释文件
nsyl.chr_to_id.tsv.gz：TSV格式的序列名称与ID映射文件
创建时间：
2025-02-05
