Nicotiana sylvestris genome assembly and annotation
收藏资源简介:
De novo genome assembly and annotation of Nicotiana sylvestris. The following files are available: nsyl.fa.gz: reference genome sequence in fasta format nsyl.gff3.gz: gene annotation in GFF3 format nsyl.gtf.gz: gene annotation in GTF format nsyl.tx.fa.gz: transcript sequences in fasta format nsyl.cds.fa.gz: coding sequences in fasta format nsyl.prot.fa.gz: protein sequences in fasta format nsyl.tsv.gz: gene functional annotation in TSV format nsyl.rt.fa.gz: retrotransposon sequences in fasta format nsyl.rt.gff3.gz: retrotransposon annotation on GFF3 format nsyl.rt.tsv.gz: retrotransposon annotation in TSV format nsyl.chr_to_id.tsv.gz: mapping of sequence names to ids in TSV format
林烟草(Nicotiana sylvestris)的从头基因组组装与注释。 本次数据集包含以下文件: nsyl.fa.gz:FASTA格式的参考基因组序列 nsyl.gff3.gz:GFF3格式的基因注释文件 nsyl.gtf.gz:GTF格式的基因注释文件 nsyl.tx.fa.gz:FASTA格式的转录本序列 nsyl.cds.fa.gz:FASTA格式的编码序列(CDS) nsyl.prot.fa.gz:FASTA格式的蛋白质序列 nsyl.tsv.gz:TSV格式的基因功能注释文件 nsyl.rt.fa.gz:FASTA格式的逆转录转座子序列 nsyl.rt.gff3.gz:GFF3格式的逆转录转座子注释文件 nsyl.rt.tsv.gz:TSV格式的逆转录转座子注释文件 nsyl.chr_to_id.tsv.gz:TSV格式的序列名称与ID映射文件




