Functional trait data for taxa recorded at SAFE

Name: Functional trait data for taxa recorded at SAFE
Creator: Zenodo
Published: 2023-04-03T09:28:51+08:00

Zenodo2023-04-03 更新2026-05-26 收录

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Description: A matrix of functional and morphological data linked to taxa recorded in one or more of the individual datasets held on the SAFE Project safedata repositoryProject: This dataset was collected as part of the following SAFE research project: Above ground net primary productivityXML metadata: GEMINI compliant metadata for this dataset is available hereFiles: This dataset consists of 3 files: SAFE_Functional_Groups_template.xlsx, functional_traits.r, external_files.zipSAFE_Functional_Groups_template.xlsxThis file contains dataset metadata and 1 data tables:Functional trait data for taxa recorded at SAFE (described in worksheet TraitMatrix)Description: A matrix of functional and morphological data linked to taxa recorded in one or more of the individual datasets held on the SAFE Project safedata repositoryNumber of fields: 61Number of data rows: 7367Fields: kingdom: Additional taxonomic information (Field type: id)phylum: Additional taxonomic information (Field type: id)class: Additional taxonomic information (Field type: id)order: Additional taxonomic information (Field type: id)family: Additional taxonomic information (Field type: id)genus: Additional taxonomic information (Field type: id)species: Additional taxonomic information (Field type: id)subspecies: Additional taxonomic information (Field type: id)variety: Additional taxonomic information (Field type: id)form: Additional taxonomic information (Field type: id)taxon_name: Code name used to identify the taxon in safedata (Field type: taxa)taxon_level: Taxonomic level to which the taxon has been identified (Field type: categorical trait)TaxonType: Broadly defined taxonomic category the taxon belongs to. (Field type: categorical trait)RedList: IUCN Red List threat status (Field type: categorical trait)BodyMass: Average body mass (Field type: numeric trait)Development: Life history development status (Field type: categorical trait)Physiology: Body physiology (Field type: categorical trait)Movement: Primary method of movement (Field type: categorical trait)Sociality: Social status of the taxon (Field type: categorical trait)StraLifeHist: Records whether the taxon forages in a single habitat for their entire life cycle or if they exploit different habitats at different periods (eg tadpoles are aquatic but adult frogs might be terrestrial) (Field type: categorical trait)StraUnd: Understory - forages in the understory (Field type: categorical trait)StraAqu: Aquatic - forages in water (Field type: categorical trait)StraAer: Aerial - forages on the wing (Field type: categorical trait)StraArb: Arboreal - forages in the canopy (Field type: categorical trait)StraTerr: Terrestrial - forages on the ground (Field type: categorical trait)StraSub: Subterranean - feeds on below-ground food sources (Field type: categorical trait)StrataGeneralism: Number of habitat strata in which the taxon forages - a measure of habitat generalism (Field type: numeric trait)TrophCarn: Carnivore (Field type: categorical trait)TrophHerb: Herbivore (Field type: categorical trait)TrophProd: Producer (plant) (Field type: categorical trait)TrophSap: Saprophage (Field type: categorical trait)TrophToid: Parasitoid (Field type: categorical trait)TrophPara: Parasite (Field type: categorical trait)TrophicGeneralism: Number of trophic categories the taxon belongs to; a measure of trophic generalism or omnivory (Field type: numeric trait)DietCop: Coprophage - feeds on faeces (Field type: categorical trait)DietDet: Detritivore - feeds on dead leaves (Field type: categorical trait)DietPisc: Piscivore - feeds on fish (Field type: categorical trait)DietVert: Vertivore - feeds on vertebrates (Field type: categorical trait)DietInvert: Invertivore - feeds on invertebrates (Field type: categorical trait)DietAlg: Algivore - feeds on algae (Field type: categorical trait)DietSapro: Saproxylic - feeds on dead wood (Field type: categorical trait)DietMyco: Mycophage - feeds on fungi (Field type: categorical trait)DietXylo: Xylophage - feeds on wood (Field type: categorical trait)DietNec: Nectarivore - feeds on nectar (Field type: categorical trait)DietNecro: Necrophage - feeds on carrion (Field type: categorical trait)DietGran: Granivore - feeds on seeds (Field type: categorical trait)DietFrug: Frugivore - feeds on fruits (Field type: categorical trait)DietFoli: Folivore - feeds on leaves (Field type: categorical trait)DietFlor: Florivore - feeds on flowers (Field type: categorical trait)DietSoil: Soilphage - feeds on soil (Field type: categorical trait)DietHema: Hematophage - feeds on blood (Field type: categorical trait)DietRhyzo: Rhizophage - feeds on roots (Field type: categorical trait)DietPhloe: Phloeophage - feeds on phloem (Field type: categorical trait)DietPaly: Palynivore - feeds on pollen (Field type: categorical trait)DietGeneralism: Number of diet categories associated with this taxon; a measure of dietary generalism (Field type: numeric trait)PlantWoodDens: Wood density (Field type: numeric trait)PlantRuderal: Plant ruderal strategy (Field type: numeric trait)PlantStress: Plant stress strategy (Field type: numeric trait)PlantComp: Plant competitor strategy (Field type: numeric trait)PlantPhotoCap: Photosynthetic capacity (Field type: numeric trait)DietBact: Bacteriovore/bacteriophage (Field type: categorical trait)functional_traits.rDescription: R code used to generate and compile functional and morphological dataexternal_files.zipDescription: External files read in from other databases and used to populate functional traitsDate range: 2010-07-01 to 2020-12-01Latitudinal extent: 4.6353 to 4.7714Longitudinal extent: 116.9477 to 117.7028Taxonomic coverage: All taxon names are validated against the GBIF backbone taxonomy. If a dataset uses a synonym, the accepted usage is shown followed by the dataset usage in brackets. Taxa that cannot be validated, including new species and other unknown taxa, morphospecies, functional groups and taxonomic levels not used in the GBIF backbone are shown in square brackets. - Animalia - - Hodotermes - - Datames - - Annelida - - - Clitellata - - - - Arhynchobdellida - - - - - Haemadipsidae - - - - - - Haemadipsa - - - - - - Haemadipsa - - - - - - - Haemadipsa picta - - - - Oligochaeta - - Arthropoda - - - Arachnida - - - - Araneae - - - - - Anapidae - - - - - - [ANA01] - - - - - Araneidae - - - - - - Gasteracantha - - - - - - [ARA01] - - - - - - [ARA02] - - - - - - [ARA03] - - - - - - [ARA04] - - - - - - [ARA05] - - - - - - [ARA06] - - - - - - [ARA07] - - - - - - [ARA08] - - - - - - [ARA09] - - - - - - [ARA10] - - - - - - [ARA11] - - - - - - [ARA12] - - - - - - [ARA13] - - - - - - [ARA14] - - - - - - [ARA15] - - - - - - [ARA16] - - - - - Cheiracanthiidae - - - - - Corinnidae - - - - - - [COR01] - - - - - - [COR02] - - - - - - [COR03] - - - - - - [COR04] - - - - - - [COR05] - - - - - Dictynidae - - - - - - [DIC01] - - - - - Gnaphosidae - - - - - - [GNA01] - - - - - Hahniidae - - - - - - [HAH01] - - - - - - [HAH02] - - - - - Hersiliidae - - - - - - [HER01] - - - - - Linyphiidae - - - - - - [LIN01] - - - - - - [LIN02] - - - - - Mimetidae - - - - - - [MIM01] - - - - - - [MIM02] - - - - - - [MIM03] - - - - - Mysmenidae - - - - - - [MYS01] - - - - - - [MYS02] - - - - - - [MYS03] - - - - - Oonopidae - - - - - - [OON01] - - - - - - [OON02] - - - - - - [OON03] - - - - - - [OON05] - - - - - - [OON06] - - - - - - [OON08] - - - - - - [OON09] - - - - - - [OON10] - - - - - - [OON11] - - - - - Oxyopidae - - - - - - [OXY01] - - - - - - [OXY02] - - - - - - [OXY03] - - - - - - [OXY04] - - - - - - [OXY05] - - - - - - [OXY06] - - - - - Pholcidae - - - - - - [PHO01] - - - - - - [PHO02] - - - - - - [PHO03] - - - - - - [PHO04] - - - - - - [PHO05] - - - - - - [PHO06] - - - - - - [PHO07] - - - - - - [PHO08] - - - - - - [PHO09] - - - - - - [PHO11] - - - - - - [PHO13] - - - - - Pisauridae - - - - - - [PIS01] - - - - - Salticidae - - - - - - [SAL01] - - - - - - [SAL02] - - - - - - [SAL03] - - - - - - [SAL04] - - - - - - [SAL05] - - - - - - [SAL06] - - - - - - [SAL07] - - - - - - [SAL08] - - - - - - [SAL09] - - - - - - [SAL10] - - - - - - [SAL11] - - - - - - [SAL12] - - - - - - [SAL13] - - - - - - [SAL14] - - - - - - [SAL15] - - - - - - [SAL16] - - - - - - [SAL17] - - - - - - [SAL18] - - - - - - [SAL19] - - - - - - [SAL20] - - - - - - [SAL21] - - - - - - [SAL22] - - - - - - [SAL23] - - - - - - [SAL24] - - - - - - [SAL25] - - - - - - [SAL26] - - - - - - [SAL27] - - - - - - [SAL28] - - - - - - [SAL29] - - - - - - [SAL30] - - - - - - [SAL31] - - - - - - [SAL32] - - - - - - [SAL33] - - - - - - [SAL34] - - - - - - [SAL35] - - - - - - [SAL36] - - - - - - [SAL37] - - - - - - [SAL38] - - - - - - [SAL39] - - - - - - [SAL40] - - - - - - [SAL41] - - - - - - [SAL42] - - - - - - [SAL43] - - - - - - [SAL44] - - - - - - [SAL45] - - - - - - [SAL46] - - - - - - [SAL47] - - - - - Scytodidae - - - - - - [SCY01] - - - - - Tetrablemmidae - - - - - - [TE

**描述：** 与SAFE项目safedata知识库中收录的一个或多个独立数据集内记录的分类单元相关联的功能与形态学数据矩阵 **项目：** 本数据集采集自以下SAFE研究项目：**地上净初级生产力** **XML元数据：** 本数据集符合GEMINI标准的元数据可在此处获取 **文件列表：** 本数据集包含3个文件：SAFE_Functional_Groups_template.xlsx、functional_traits.r 及 external_files.zip **SAFE_Functional_Groups_template.xlsx** 该文件包含数据集元数据与1张数据表：**SAFE项目记录分类单元的功能性状数据**（位于TraitMatrix工作表中） **描述：** 与SAFE项目safedata知识库中收录的一个或多个独立数据集内记录的分类单元相关联的功能与形态学数据矩阵字段数量：61 数据行数：7367 字段详情： **界**：补充分类学信息（字段类型：ID） **门**：补充分类学信息（字段类型：ID） **纲**：补充分类学信息（字段类型：ID） **目**：补充分类学信息（字段类型：ID） **科**：补充分类学信息（字段类型：ID） **属**：补充分类学信息（字段类型：ID） **种**：补充分类学信息（字段类型：ID） **亚种**：补充分类学信息（字段类型：ID） **变种**：补充分类学信息（字段类型：ID） **变型**：补充分类学信息（字段类型：ID） **分类单元名称**：safedata中用于标识分类单元的代码名称（字段类型：分类单元） **分类层级**：该分类单元的鉴定层级（字段类型：分类性状） **分类单元类型**：该分类单元所属的广义分类类别（字段类型：分类性状） **红色名录**：IUCN红色名录受威胁等级（字段类型：分类性状） **体重**：平均体重（字段类型：数值性状） **发育状态**：生活史发育状态（字段类型：分类性状） **生理特征**：躯体生理特征（字段类型：分类性状） **运动方式**：主要运动方式（字段类型：分类性状） **社会行为**：该分类单元的社会行为特征（字段类型：分类性状） **栖息地利用模式**：记录该分类单元是否在整个生命周期内仅在单一栖息地觅食，或在不同发育阶段利用不同栖息地（例如蝌蚪为水生，而成年蛙可为陆生）（字段类型：分类性状） **林下觅食**：林下层觅食（字段类型：分类性状） **水生觅食**：水体中觅食（字段类型：分类性状） **空中觅食**：飞行中觅食（字段类型：分类性状） **树栖觅食**：冠层觅食（字段类型：分类性状） **陆生觅食**：地面觅食（字段类型：分类性状） **地下觅食**：取食地下食物源（字段类型：分类性状） **栖息地泛化指数**：该分类单元觅食的栖息地层数量，用于衡量栖息地泛化程度（字段类型：数值性状） **食肉营养型**：食肉动物（字段类型：分类性状） **草食营养型**：草食动物（字段类型：分类性状） **生产者营养型**：生产者（植物）（字段类型：分类性状） **腐食营养型**：腐食性生物（字段类型：分类性状） **寄生天敌营养型**：寄生性天敌（字段类型：分类性状） **寄生营养型**：寄生虫（字段类型：分类性状） **营养泛化指数**：该分类单元所属的营养类群数量，用于衡量营养泛化程度或杂食性（字段类型：数值性状） **食粪性**：以粪便为食（字段类型：分类性状） **食腐性**：以枯叶为食（字段类型：分类性状） **食鱼性**：以鱼类为食（字段类型：分类性状） **食脊椎动物性**：以脊椎动物为食（字段类型：分类性状） **食无脊椎动物性**：以无脊椎动物为食（字段类型：分类性状） **食藻类**：以藻类为食（字段类型：分类性状） **木腐性**：以枯木为食（字段类型：分类性状） **食真菌性**：以真菌为食（字段类型：分类性状） **食木性**：以木材为食（字段类型：分类性状） **食花蜜性**：以花蜜为食（字段类型：分类性状） **食腐肉性**：以腐肉为食（字段类型：分类性状） **食种子性**：以种子为食（字段类型：分类性状） **食果性**：以果实为食（字段类型：分类性状） **食叶性**：以叶片为食（字段类型：分类性状） **食花性**：以花朵为食（字段类型：分类性状） **食土性**：以土壤为食（字段类型：分类性状） **吸血性**：以血液为食（字段类型：分类性状） **食根性**：以根系为食（字段类型：分类性状） **食韧皮部性**：以韧皮部为食（字段类型：分类性状） **食花粉性**：以花粉为食（字段类型：分类性状） **饮食泛化指数**：与该分类单元相关的饮食类群数量，用于衡量饮食泛化程度（字段类型：数值性状） **木材密度**：木材密度（字段类型：数值性状） **杂草化策略**：植物杂草化策略（字段类型：数值性状） **胁迫策略**：植物胁迫策略（字段类型：数值性状） **竞争策略**：植物竞争策略（字段类型：数值性状） **光合能力**：光合能力（字段类型：数值性状） **食细菌性**：以细菌为食/噬菌作用（字段类型：分类性状） **functional_traits.r** **描述：** 用于生成并整合功能与形态学数据的R代码 **external_files.zip** **描述：** 从其他数据库导入、用于填充功能性状数据的外部文件 **数据时间范围：** 2010年7月1日至2020年12月1日 **纬度范围：** 4.6353至4.7714 **经度范围：** 116.9477至117.7028 **分类覆盖范围：** 所有分类单元名称均依据GBIF骨干分类法进行验证。若数据集使用了异名，则先显示接受的正确名称，随后在括号中标注数据集所使用的异名。无法验证的分类单元（包括新种及其他未知类群、形态种、功能群以及GBIF骨干分类法未收录的分类层级）将以方括号标注。 - 动物界 —— Hodotermes 属 —— Datames 属 —— 环节动物门 ——— 环带纲 ———– 无吻蛭目 ———–– 山蛭科 ———––– Haemadipsa 属 ———––– Haemadipsa 属 ———–––– Haemadipsa picta ———– 寡毛纲 —— 节肢动物门 ——— 蛛形纲 ———– 蜘蛛目 ———–– 安蛛科 ———––– [ANA01] ———–– 园蛛科 ———––– Gasteracantha 棘腹蛛属 ———––– [ARA01] ———––– [ARA02] ———––– [ARA03] ———––– [ARA04] ———––– [ARA05] ———––– [ARA06] ———––– [ARA07] ———––– [ARA08] ———––– [ARA09] ———––– [ARA10] ———––– [ARA11] ———––– [ARA12] ———––– [ARA13] ———––– [ARA14] ———––– [ARA15] ———––– [ARA16] ———–– 螯螯蛛科 ———–– 暗蛛科 ———––– [COR01] ———––– [COR02] ———––– [COR03] ———––– [COR04] ———––– [COR05] ———–– 卷叶蛛科 ———––– [DIC01] ———–– 平腹蛛科 ———––– [GNA01] ———–– 弱蛛科 ———––– [HAH01] ———––– [HAH02] ———–– Hersiliidae 科 ———––– [HER01] ———–– 皿蛛科 ———––– [LIN01] ———––– [LIN02] ———–– 突腹蛛科 ———––– [MIM01] ———––– [MIM02] ———––– [MIM03] ———–– Mysmenidae 科 ———––– [MYS01] ———––– [MYS02] ———––– [MYS03] ———–– 卵形蛛科 ———––– [OON01] ———––– [OON02] ———––– [OON03] ———––– [OON05] ———––– [OON06] ———––– [OON08] ———––– [OON09] ———––– [OON10] ———––– [OON11] ———–– 獵蛛科 ———––– [OXY01] ———––– [OXY02] ———––– [OXY03] ———––– [OXY04] ———––– [OXY05] ———––– [OXY06] ———–– 幽灵蛛科 ———––– [PHO01] ———––– [PHO02] ———––– [PHO03] ———––– [PHO04] ———––– [PHO05] ———––– [PHO06] ———––– [PHO07] ———––– [PHO08] ———––– [PHO09] ———––– [PHO11] ———––– [PHO13] ———–– 盗蛛科 ———––– [PIS01] ———–– 跳蛛科 ———––– [SAL01] ———––– [SAL02] ———––– [SAL03] ———––– [SAL04] ———––– [SAL05] ———––– [SAL06] ———––– [SAL07] ———––– [SAL08] ———––– [SAL09] ———––– [SAL10] ———––– [SAL11] ———––– [SAL12] ———––– [SAL13] ———––– [SAL14] ———––– [SAL15] ———––– [SAL16] ———––– [SAL17] ———––– [SAL18] ———––– [SAL19] ———––– [SAL20] ———––– [SAL21] ———––– [SAL22] ———––– [SAL23] ———––– [SAL24] ———––– [SAL25] ———––– [SAL26] ———––– [SAL27] ———––– [SAL28] ———––– [SAL29] ———––– [SAL30] ———––– [SAL31] ———––– [SAL32] ———––– [SAL33] ———––– [SAL34] ———––– [SAL35] ———––– [SAL36] ———––– [SAL37] ———––– [SAL38] ———––– [SAL39] ———––– [SAL40] ———––– [SAL41] ———––– [SAL42] ———––– [SAL43] ———––– [SAL44] ———––– [SAL45] ———––– [SAL46] ———––– [SAL47] ———–– 花皮蛛科 ———––– [SCY01] ———–– 四盾蛛科 ———––– [TE

提供机构：

Zenodo

创建时间：

2023-04-03

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