Amazonian mammal monitoring using aquatic environmental DNA

Name: Amazonian mammal monitoring using aquatic environmental DNA
Creator: figshare
Published: 2022-11-15 17:52:08
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DataCite Commons2022-11-15 更新2024-07-28 收录

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Run 1 Compressed file containing: 1) Forward sequence file; 2) Reverse sequence file. Run 2 Compressed file containing: 1) Forward sequence file; 2) Reverse sequence file. Run 3 Compressed file containing: 1) Forward sequence file; 2) Reverse sequence file. Run 4 Compressed file containing: 1) Forward sequence file; 2) Reverse sequence file. Run 5 Compressed file containing: 1) Forward sequence file; 2) Reverse sequence file. Run 6 Compressed file containing: 1) Forward sequence file; 2) Reverse sequence file. Run 7 Compressed file containing: 1) Forward sequence file; 2) Reverse sequence file. Run 8 Compressed file containing: 1) Forward sequence file; 2) Reverse sequence file. Run 9 Compressed file containing: 1) Forward sequence file; 2) Reverse sequence file. Run 10 Compressed file containing: 1) Forward sequence file; 2) Reverse sequence file. Run 11 Compressed file containing: 1) Forward sequence file; 2) Reverse sequence file. Run 12 Compressed file containing: 1) Forward sequence file; 2) Reverse sequence file. Run 13 Site data A table with 1)Site name, 2)Drainage basin, 3)Latitude, 4)Longitude, 5)Strahler order, 6)Watercourse type, 7)Sampling years, 9)PCR sample name for Replicate 1, 10)PCR sample name for Replicate 2 Compressed file containing: 1) Forward sequence file; 2) Reverse sequence file. Run 14 Compressed file containing: 1) Forward sequence file; 2) Reverse sequence file. Sites_data.csv Metadata A table with 1)Library name, 2)Drainage basin, 3)PCR sample name, 4)Tag, 5)Reverse primer, 6)Forward primer, 7)Run number Metadata.csv A table with 1)Library name, 2)Drainage basin, 3)PCR sample name, 4)PCR number, 5)Tag, 6)Reverse primer, 7)Forward primer, 8)Run number Metadata_Sinnamary_Fish

测序运行1：压缩归档文件包含：1) 正向序列文件；2) 反向序列文件。 测序运行2：压缩归档文件包含：1) 正向序列文件；2) 反向序列文件。 测序运行3：压缩归档文件包含：1) 正向序列文件；2) 反向序列文件。 测序运行4：压缩归档文件包含：1) 正向序列文件；2) 反向序列文件。 测序运行5：压缩归档文件包含：1) 正向序列文件；2) 反向序列文件。 测序运行6：压缩归档文件包含：1) 正向序列文件；2) 反向序列文件。 测序运行7：压缩归档文件包含：1) 正向序列文件；2) 反向序列文件。 测序运行8：压缩归档文件包含：1) 正向序列文件；2) 反向序列文件。 测序运行9：压缩归档文件包含：1) 正向序列文件；2) 反向序列文件。 测序运行10：压缩归档文件包含：1) 正向序列文件；2) 反向序列文件。 测序运行11：压缩归档文件包含：1) 正向序列文件；2) 反向序列文件。 测序运行12：压缩归档文件包含：1) 正向序列文件；2) 反向序列文件。 测序运行13： 站点数据：包含如下字段的表格：1) 站点名称；2) 流域(Drainage basin)；3) 纬度(Latitude)；4) 经度(Longitude)；5) 斯特拉勒分级(Strahler order)；6) 河道类型；7) 采样年份；9) 重复1的聚合酶链式反应(PCR)样本名称；10) 重复2的聚合酶链式反应(PCR)样本名称。 对应压缩归档文件包含：1) 正向序列文件；2) 反向序列文件。 测序运行14：压缩归档文件包含：1) 正向序列文件；2) 反向序列文件。 Sites_data.csv 元数据(Metadata)：包含如下字段的表格：1) 文库名称；2) 流域；3) 聚合酶链式反应(PCR)样本名称；4) 标签(Tag)；5) 反向引物(Reverse primer)；6) 正向引物(Forward primer)；7) 运行编号，对应文件为Metadata.csv。 另有元数据表格Metadata_Sinnamary_Fish，包含如下字段：1) 文库名称；2) 流域；3) 聚合酶链式反应(PCR)样本名称；4) PCR编号；5) 标签(Tag)；6) 反向引物(Reverse primer)；7) 正向引物(Forward primer)；8) 运行编号。

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figshare

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2021-02-10

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