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DME_DATA

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DataCite Commons2023-08-27 更新2024-08-26 收录
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These experiments are used for evaluating algorithms for detecting disease-causing SNPs.The real data is originally genereted by [1] and [2].The simulations and experiments are designed by [3].<br><br>[1] Yang C-H, Lin Y-D, Chuang L-Y, Chang H-W. Evaluation of breast cancer susceptibility using improved genetic algorithms to generate genotype SNP barcodes. IEEE/ACM transactions on computational biology and bioinformatics. 2013;10(2):361-71.[2] Li X, Jiang W. Method for generating multiple risky barcodes of complex diseases using ant colony algorithm. Theoretical Biology and Medical Modelling. 2017;14(1):1-12[3] Tuo S, Liu H, Chen H. Multipopulation harmony search algorithm for the detection of high-order SNP interactions. Bioinformatics. 2020;36(16):4389-98<br><br>

本系列实验用于评估致病单核苷酸多态性(Single Nucleotide Polymorphism,SNP)的检测算法。原始真实数据集由文献[1]与[2]生成,本次实验的仿真设计与实验方案均源自文献[3]。 [1] Yang C-H, Lin Y-D, Chuang L-Y, Chang H-W. 基于改进遗传算法生成基因型SNP条形码以评估乳腺癌易感性. IEEE/ACM计算生物学与生物信息学汇刊. 2013;10(2):361-71. [2] Li X, Jiang W. 基于蚁群算法生成复杂疾病多风险条形码的方法. 理论生物学与医学建模. 2017;14(1):1-12. [3] Tuo S, Liu H, Chen H. 用于检测高阶SNP交互作用的多群体和声搜索算法. 生物信息学. 2020;36(16):4389-98
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创建时间:
2023-08-27
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