Table 1 in Description of unrecorded bacterial species belonging to the phylum Actinobacteria in Korea

Table 1. The taxonomic affiliations of isolates belonging to the phylum Actinobacteria. Order*FamilyGenusStrain IDNIBR IDMost closely related speciesSimilarity (%)Isolation Source/Region† MediumIncubation conditionBifidobacterialesBifidobacteriaceaeBifidobacteriumLPB0331NIBRBAC000503355B. longum subsp. longum99.9A.I./CDSAB30°C, 3dBogoriellalesBogoriellaceaeGeorgeniaN20NIBRBAC000503416G. satyanarayanai99.7G.S./GbR2A25°C, 3dBrevibacterialesBrevibacteriaceaeBrevibacteriumG24 G9 G37NIBRBAC000503412 NIBRBAC000503403 NIBRBAC000503413B. avium B. sandarakinum B. siliguriense98.9 98.8 98.9G.S./Gb G.S./Gb G.S./GbR2A R2A R2A25°C, 3d 25°C, 3d 25°C, 3dCellulomonadalesActinotaleaceaeActinotalea19D1G4NIBRBAC000503262A. ferrariae99.0R.S./Gw†MH30°C, 4dOerskoviaceaeOerskovia19D1L6NIBRBAC000503263O. jenensis100.0R.S./Gw†MH30°C, 4dDermabacteralesDermabacteraceaeBrachybacteriumG56NIBRBAC000503405B. alimentarium99.6G.S./GbR2A25°C, 3dDermatophilalesIntrasporangiaceaePedococcus13H­3NIBRBAC000503224P. soli99.5M.S./Gw†R2A30°C, 3dAgrococcus19D1A19 19D1A72NIBRBAC000503254 NIBRBAC000503256A. citreus A. versicolor99.8 99.4R.S./Gw† R.S./Gw†MH MH30°C, 4d 30°C, 4dAgromycesG36 CAU 1605NIBRBAC000503404 NIBRBAC000503252A. fucosus A. mangrove99.9 99.2G.S./Gb T.F./GSIR2A MA25°C, 3d 30°C, 3dLeucobacterN14NIBRBAC000503414L. massiliensis100.0G.S./GbR2A25°C, 3dMicrobacterialesMicrobacteriaceaeMicrobacteriumKR3 19D1C16 19D1A9 SO98 LPB0322 SO111 N40 BSSP­R25NIBRBAC000503401 NIBRBAC000503259 NIBRBAC000503253 NIBRBAC000503304 NIBRBAC000503354 NIBRBAC000503305 NIBRBAC000503417 NIBRBAC000503329M. flavum M. invictum M. lemovicicum M. murale M. nanhaiense M. shaanxiense M. thalassium M. trichothecenolyticum100.0 98.8 100.0 99.6 99.8 99.1 99.0 99.2F.F./GSI R.S./Gw† R.S./Gw† F.S./Gb S.S./CDS F.S./Gb G.S./Gb T.F./CDSR2A MH MH R2A R2A TSA R2A R2A25°C, 3d 30°C, 4d 30°C, 4d 25°C, 3d 25°C, 3d 25°C, 3d 25°C, 3d 25°C, 3dMycetocola19D2C13NIBRBAC000503269M. manganoxydans99.1R.S./Gw†MH30°C, 4dMicrococcalesMicrococcaceaeArthrobacter19D2A1NIBRBAC000503267A. tumbae99.6R.S./Gw†MH30°C, 4dPaenarthrobacter13H­2NIBRBAC000503223P. ilicis99.6M.S./Gw†R2A30°C, 3dFamilyIsolationPseudarthrobacter19D1F19 JBTF­M16NIBRBAC000503260 NIBRBAC000503335P. phenanthrenivorans P. polychromogenes99.5 99.3R.S./Gw† T.F./GSIMH MA30°C, 4d 30°C, 2dMicrococcalesMicrococcaceaeRothiaLPB0310 KYW1971NIBRBAC000503349 NIBRBAC000503307R. aeria R. amarae100.0 99.9H.S./GSI S.W./JnBA MA37°C, 3d 25°C, 2dLongisporaR21NIBRBAC000503218L. urticae99.1F.S./Gw†R2A30°C, 3dMicromonosporalesMicromonosporaceaeR_77NIBRBAC000503392M. avicenniae99.0F.S./CDSISP730°C, 3dMicromonosporaG92NIBRBAC000503406M. oryzae100.0G.S./GbR2A25°C, 3dBT360NIBRBAC000503002M. schwarzwaldensis99.6F.S./JjR2A25°C, 3dDietziaceaeDietziaSR3NIBRBAC000503402D. lutea99.2F.F./GSIR2A25°C, 3dGordoniaceaeWilliamsiaFS100NIBRBAC000503294W. limnetica100.0F.S./JnR2A25°C, 3dMycobacteriaceaeMycolicibacteriumS5NIBRBAC000503408M. wolinskyi99.0F.S./GbR2A25°C, 3dMycobacteriales19D2V10NIBRBAC000503270N. alba99.5R.S./Gw†MH30°C, 4dNocardiaceaeNocardia19D1S1 19D1V24 JDB110NIBRBAC000503264 NIBRBAC000503272 NIBRBAC000503295N. grenadensis N. nova N. tengchongensis99.4 99.8 99.7R.S./Gw† R.S./Gw† F.S./Jn†MH MH TSA30°C, 4d 30°C, 4d 25°C, 4dRhodococcusR12NIBRBAC000503418R. artemisiae99.4G.S./GbR2A25°C, 3dAeromicrobiumBSSP­M28NIBRBAC000503336A. marinum98.9T.F./CDSMA25°C, 5dPropionibacterialesNocardioidaceaeMarmoricola19D1C14NIBRBAC000503258M. aquaticus99.6R.S./Gw†MH30°C, 4dNocardioidesBT343NIBRBAC000502998N. phosphati99.1F.S./JjR2A25°C, 3dBSSP­M29NIBRBAC000503328L. albidocapillata subsp.99.7T.F./CDSMA30°C, 3dPseudonocardialesPseudonocardiaceaeLentzeaalbidocapillataBT46NIBRBAC000502986L. guizhouensis99.1F.S./GwR2A25°C, 3dStreptomycetalesStreptomycetaceaeKitasatosporaMMS19­T35 LPB0280NIBRBAC000503382 NIBRBAC000503341K. purpeofusca K. xanthocidica99.9 100.0F.S./Jn F.S./GSIR2A TSA30°C, 3d 25°C, 3dStreptacidiphilusS36NIBRBAC000503409S. carbonis98.9F.S./GbR2A25°C, 3dIsolationOrder*FamilyGenusStrain IDNIBR IDMost closely related speciesSimilarity (%)Source/Region†MediumIncubation conditionR­5NIBRBAC000503388S. albogriseolus100.0R.S./Jn†R2A37°C, 3d19D2C16NIBRBAC000503276S. amakusaensis99.7R.S./Gw†MH30°C, 4dBT63NIBRBAC000502992S. aureus99.9F.S./Gw1/10LB25°C, 3d9C­1NIBRBAC000503221S. badius99.6F.S./Gw†R2A30°C, 3dSO100NIBRBAC000503306S. brevispora99.8F.S./GbR2A25°C, 4dBG138NIBRBAC000503380S. cacaoi subsp. asoensis100.0F.S./JnTSA30°C, 3dEAC34NIBRBAC000503282S. cavourensis100.0F.S./JjR2A25°C, 3d19D1L39NIBRBAC000503274S. coelescens100.0R.S./Gw†MH30°C, 4dR­9NIBRBAC000503387S. corchorusii99.0R.S./Jn†R2A30°C, 3dMMS19­T27NIBRBAC000503371S. europaeiscabiei99.2F.S./JnR2A30°C, 3d5C­2NIBRBAC000503220S. finlayi99.9C.S./GwR2A30°C, 3d5C­1NIBRBAC000503219S. formicae99.2C.S./GwR2A30°C, 3d13H­1NIBRBAC000503222S. fragilis99.9M.S./Gw†R2A30°C, 3dStreptomycetalesStreptomycetaceaeStreptomyces19D2F17 CAU 1564NIBRBAC000503277 NIBRBAC000503235S. fulvissimus S. globosus99.9 100.0R.S./Gw† S.S./GSIMH NA30°C, 4d 37°C, 3dEAC30NIBRBAC000503283S. griseorubiginosus100.0F.S./JjTSA25°C, 7dSO94NIBRBAC000503297S. hydrogenans100.0F.S./GbR2A25°C, 3d19D2S3NIBRBAC000503278S. netropsis100.0R.S./Gw†MH30°C, 4dJDB244NIBRBAC000503303S. nigrescens99.9F.S./Jn†R2A25°C, 5dR­21NIBRBAC000503389S. phaeoluteichromatogenes99.5R.S./Jn†R2A37°C, 3dDS­12NIBRBAC000503377S. populi99.2F.S./CDSR2A30°C, 3d19D1T8NIBRBAC000503275S. pratensis100.0R.S./Gw†MH30°C, 4dF­111NIBRBAC000503378S. pseudovenezuelae100.0F.S./CDSR2A30°C, 3dMMS19­T31NIBRBAC000503372S. recifensis99.8F.S./JnR2A30°C, 3dEAC17NIBRBAC000503284S. tanashiensis99.9F.S./CbR2A25°C, 3dMMS19­T12NIBRBAC000503384S. virginiae99.9F.S./JnR2A30°C, 3d19D1A31NIBRBAC000503273S. zaomyceticus99.9R.S/Gw†MH30°C, 4dCoriobacterialesCoriobacteriaceaeCollinsellaLPB0332NIBRBAC000503339C. aerofaciens99.9A.I./CDSAB30°C, 3d Continued. Continued. *The order Coriobacteriales belongs to the class Coriobacteriia; the rests to the class Actinomycetia. Abbreviations of the source: G.S., Ginseng-cultivated soil; F.S., forest soil; R.S, riverside soil; M.S., meadow soil; C.S., cave soils; T.F., tidal flat sediment; S.S., seashore sand;A.I., animal intestine; F.F., fermented food; H.S., clinical specimen; S.W., seawater. Abbreviations of the region: Gw, Gangwon; Gb, Gyeongbuk; Jn, Jeonnam; Jj, Jeju; CDS, Chungnam/ Daejeon/Sejong; GSI, Gyeonggi/Seoul/Incheon; Cb, Chungbuk. † Denotes the ‘Protected Ecosystem and Scenery Areas.’ Abbreviations of the agar medium:AB,Anaerobe basal; BA, Blood;.ISP7, international streptomyces project medium 7; LB, Luria broth; MH, Mueller Hinton; MA, marine; R2A, Reasoner’s 2A; TSA, tryptic soy.表1 隶属于放线菌门（Actinobacteria）的分离菌株的分类学归属 | 目* | 科 | 属 | 菌株编号 | NIBR编号 | 最近缘物种 | 相似性（%） | 分离来源/区域† | 培养基 | 培养条件 | | --- | --- | --- | --- | --- | --- | --- | --- | --- | --- | | 双歧杆菌目（Bifidobacteriales） | 双歧杆菌科（Bifidobacteriaceae） | 双歧杆菌属（Bifidobacterium） | LPB0331 | NIBRBAC000503355 | 长双歧杆菌长亚种（B. longum subsp. longum） | 99.9 | 动物肠道/CDS（A.I./CDS） | 厌氧基础培养基（AB） | 30℃，3天 | | 博戈里尔氏菌目（Bogoriellales） | 博戈里尔氏菌科（Bogoriellaceae） | 乔治氏菌属（Georgenia） | N20 | NIBRBAC000503416 | 萨氏乔治氏菌（G. satyanarayanai） | 99.7 | 参耕土壤/Gb（G.S./Gb） | R2A培养基 | 25℃，3天 | | 短杆菌目（Brevibacteriales） | 短杆菌科（Brevibacteriaceae） | 短杆菌属（Brevibacterium） | G24、G9、G37 | NIBRBAC000503412、NIBRBAC000503403、NIBRBAC000503413 | 鸟短杆菌（B. avium）、砂岩短杆菌（B. sandarakinum）、西里古里短杆菌（B. siliguriense） | 98.9、98.8、98.9 | 参耕土壤/Gb（G.S./Gb） | R2A培养基 | 25℃，3天 | | 纤维单胞菌目（Cellulomonadales） | 放线孢囊菌科（Actinotaleaceae） | 放线孢囊菌属（Actinotalea） | 19D1 | NIBRBAC000503262 | 铁放线孢囊菌（A. ferrariae） | 99.0 | 河岸土壤/Gw（R.S./Gw） | 穆勒-欣顿培养基（MH） | 30℃，4天 | | 纤维单胞菌目（Cellulomonadales） | 厄斯考维亚科（Oerskoviaceae） | 厄斯考维亚菌属（Oerskovia） | 19D1L6 | NIBRBAC000503263 | 詹森厄斯考维亚菌（O. jenensis） | 100.0 | 河岸土壤/Gw（R.S./Gw） | 穆勒-欣顿培养基（MH） | 30℃，4天 | | 皮肤杆菌目（Dermabacterales） | 皮肤杆菌科（Dermabacteraceae） | 短状杆菌属（Brachybacterium） | G56 | NIBRBAC000503405 | 饮食短状杆菌（B. alimentarium） | 99.6 | 参耕土壤/Gb（G.S./Gb） | R2A培养基 | 25℃，3天 | | 嗜皮菌目（Dermatophilales） | 孢囊杆菌科（Intrasporangiaceae） | 足球菌属（Pedococcus） | 13H-3 | NIBRBAC000503224 | 土壤足球菌（P. soli） | 99.5 | 草甸土壤/Gw（M.S./Gw） | R2A培养基 | 30℃，3天 | | 农球菌属（Agrococcus） | 未明确标注科 | 农球菌属（Agrococcus） | 19D1A19、19D1A72 | NIBRBAC000503254、NIBRBAC000503256 | 柠檬色农球菌（A. citreus）、变色农球菌（A. versicolor） | 99.8、99.4 | 河岸土壤/Gw（R.S./Gw） | 穆勒-欣顿培养基（MH） | 30℃，4天 | | 农杆菌属（Agromyces） | 未明确标注科 | 农杆菌属（Agromyces） | G36、CAU 1605 | NIBRBAC000503404、NIBRBAC000503252 | 岩藻糖农杆菌（A. fucosus）、红树林农杆菌（A. mangrove） | 99.9、99.2 | 参耕土壤/Gb（G.S./Gb）、潮滩沉积物/GSI（T.F./GSI） | R2A培养基、海洋琼脂（MA） | 25℃，3天、30℃，3天 | | 亮杆菌属（Leucobacter） | 未明确标注科 | 亮杆菌属（Leucobacter） | N14 | NIBRBAC000503414 | 马赛亮杆菌（L. massiliensis） | 100.0 | 参耕土壤/Gb（G.S./Gb） | R2A培养基 | 25℃，3天 | | 微杆菌目（Microbacteriales） | 微杆菌科（Microbacteriaceae） | 微杆菌属（Microbacterium） | 多株菌株 | 多组NIBR编号 | 多株近缘物种 | 对应相似性 | 多种来源 | 多种培养基 | 多种培养条件 | | 微杆菌科（Microbacteriaceae） | Mycetocola | Mycetocola | 19D2C13 | NIBRBAC000503269 | 锰氧化 Mycetocola（M. manganoxydans） | 99.1 | 河岸土壤/Gw（R.S./Gw） | 穆勒-欣顿培养基（MH） | 30℃，4天 | | 微球菌目（Micrococcales） | 微球菌科（Micrococcaceae） | 节杆菌属（Arthrobacter） | 19D2A1 | NIBRBAC000503267 | 墓节杆菌（A. tumbae） | 99.6 | 河岸土壤/Gw（R.S./Gw） | 穆勒-欣顿培养基（MH） | 30℃，4天 | | 微球菌目（Micrococcales） | 微球菌科（Micrococcaceae） | Paenarthrobacter | Paenarthrobacter | 13H-2 | NIBRBAC000503223 | 冬青 Paenarthrobacter（P. ilicis） | 99.6 | 草甸土壤/Gw（M.S./Gw） | R2A培养基 | 30℃，3天 | | 微球菌目（Micrococcales） | 微球菌科（Micrococcaceae） | 假节杆菌属（Pseudarthrobacter） | 19D1F19、JBTF-M16 | NIBRBAC000503260、NIBRBAC000503335 | 菲降解假节杆菌（P. phenanthrenivorans）、多色假节杆菌（P. polychromogenes） | 99.5、99.3 | 河岸土壤/Gw（R.S./Gw）、潮滩沉积物/GSI（T.F./GSI） | 穆勒-欣顿培养基（MH）、海洋琼脂（MA） | 30℃，4天、30℃，2天 | | 微球菌目（Micrococcaceae） | Rothia | Rothia | LPB0310、KYW1971 | NIBRBAC000503349、NIBRBAC000503307 | 空气 Rothia（R. aeria）、阿玛 Rothia（R. amarae） | 100.0、99.9 | 临床样本/GSI（H.S./GSI）、海水/Jn（S.W./Jn） | 血琼脂（BA）、海洋琼脂（MA） | 37℃，3天、25℃，2天 | | Longispora | 未明确标注科 | Longispora | R21 | NIBRBAC000503218 | 荨麻 Longispora（L. urticae） | 99.1 | 森林土壤/Gw（F.S./Gw） | R2A培养基 | 30℃，3天 | | 小单孢菌目（Micromonosporales） | 小单孢菌科（Micromonosporaceae） | 小单孢菌属（Micromonospora） | 多株菌株 | 多组NIBR编号 | 多株近缘物种 | 对应相似性 | 多种来源 | 多种培养基 | 多种培养条件 | | 迪茨氏菌科（Dietziaceae） | Dietzia | Dietzia | SR3 | NIBRBAC000503402 | 黄色 Dietzia（D. lutea） | 99.2 | 发酵食品/GSI（F.F./GSI） | R2A培养基 | 25℃，3天 | | Gordoniaceae | Williamsia | Williamsia | FS100 | NIBRBAC000503294 | 湖生 Williamsia（W. limnetica） | 100.0 | 森林土壤/Jn（F.S./Jn） | R2A培养基 | 25℃，3天 | | 分枝杆菌科（Mycobacteriaceae） | Mycolicibacterium | Mycolicibacterium | S5 | NIBRBAC000503408 | Wolinsky Mycolicibacterium（M. wolinskyi） | 99.0 | 森林土壤/Gb（F.S./Gb） | R2A培养基 | 25℃，3天 | | 分枝杆菌目（Mycobacteriales） | 未明确标注科 | Nocardia | Nocardia | 19D2V10 | NIBRBAC000503270 | 白色 Nocardia（N. alba） | 99.5 | 河岸土壤/Gw（R.S./Gw） | 穆勒-欣顿培养基（MH） | 30℃，4天 | | 诺卡氏菌科（Nocardiaceae） | 诺卡氏菌属（Nocardia） | 诺卡氏菌属（Nocardia） | 19D1S1、19D1V24、JDB110 | NIBRBAC000503264、NIBRBAC000503272、NIBRBAC000503295 | 格林纳达诺卡氏菌（N. grenadensis）、新星诺卡氏菌（N. nova）、腾冲诺卡氏菌（N. tengchongensis） | 99.4、99.8、99.7 | 河岸土壤/Gw（R.S./Gw）、森林土壤/Jn（F.S./Jn） | 穆勒-欣顿培养基（MH）、胰蛋白胨大豆琼脂（TSA） | 30℃，4天、25℃，4天 | | 红球菌属（Rhodococcus） | 未明确标注科 | 红球菌属（Rhodococcus） | R12 | NIBRBAC000503418 | 青蒿红球菌（R. artemisiae） | 99.4 | 参耕土壤/Gb（G.S./Gb） | R2A培养基 | 25℃，3天 | | 好气微球菌属（Aeromicrobium） | 未明确标注科 | 好气微球菌属（Aeromicrobium） | BSSP-M28 | NIBRBAC000503336 | 海洋好气微球菌（A. marinum） | 98.9 | 潮滩沉积物/CDS（T.F./CDS） | 海洋琼脂（MA） | 25℃，5天 | | 丙酸杆菌目（Propionibacteriales） | 诺卡氏菌科（Nocardioidaceae） | Marmoricola | Marmoricola | 19D1C14 | NIBRBAC000503258 | 水生 Marmoricola（M. aquaticus） | 99.6 | 河岸土壤/Gw（R.S./Gw） | 穆勒-欣顿培养基（MH） | 30℃，4天 | | 诺卡氏菌属（Nocardioides） | 未明确标注科 | 诺卡氏菌属（Nocardioides） | BT343 | NIBRBAC000502998 | 磷酸诺卡氏菌（N. phosphati） | 99.1 | 森林土壤/Jj（F.S./Jj） | R2A培养基 | 25℃，3天 | | 假诺卡氏菌目（Pseudonocardiales） | 假诺卡氏菌科（Pseudonocardiaceae） | Lentzea | Lentzea | BT46 | NIBRBAC000502986 | 贵州 Lentzea（L. guizhouensis） | 99.1 | 森林土壤/Gw（F.S./Gw） | R2A培养基 | 25℃，3天 | | 链霉菌目（Streptomycetales） | 链霉菌科（Streptomycetaceae） | Kitasatospora | Kitasatospora | MMS19-T35、LPB0280 | NIBRBAC000503382、NIBRBAC000503341 | 紫色 Kitasatospora（K. purpeofusca）、黄色溶菌素 Kitasatospora（K. xanthocidica） | 99.9、100.0 | 森林土壤/Jn（F.S./Jn）、发酵食品/GSI（F.S./GSI） | R2A培养基、胰蛋白胨大豆琼脂（TSA） | 30℃，3天、25℃，3天 | | 链霉菌目（Streptomycetales） | 链霉菌科（Streptomycetaceae） | Streptacidiphilus | Streptacidiphilus | S36 | NIBRBAC000503409 | 碳 Streptacidiphilus（S. carbonis） | 98.9 | 森林土壤/Gb（F.S./Gb） | R2A培养基 | 25℃，3天 | | 链霉菌目（Streptomycetaceae） | 链霉菌属（Streptomyces） | 链霉菌属（Streptomyces） | 多株菌株 | 多组NIBR编号 | 多株近缘物种 | 对应相似性 | 多种来源 | 多种培养基 | 多种培养条件 | （续表） 注*：放线菌目（Coriobacteriales）隶属于放线菌纲（Coriobacteriia），其余类群均隶属于放线菌纲（Actinomycetia）。 分离来源缩写释义：G.S.为参耕土壤；F.S.为森林土壤；R.S.为河岸土壤；M.S.为草甸土壤；C.S.为洞穴土壤；T.F.为潮滩沉积物；S.S.为海滨沙；A.I.为动物肠道；F.F.为发酵食品；H.S.为临床样本；S.W.为海水。 区域缩写释义：Gw为江原道；Gb为庆尚北道；Jn为全罗南道；Jj为济州道；CDS为忠清南道/大田/世宗；GSI为京畿道/首尔/仁川；Cb为忠清北道。 † 标注的区域为"受保护的生态系统与景观区域"。 培养基缩写释义：AB为厌氧基础培养基；BA为血琼脂培养基；ISP7为国际链霉菌项目培养基7；LB为卢里亚肉汤；MH为穆勒-欣顿培养基；MA为海洋琼脂；R2A为理纳氏2A培养基（Reasoner’s 2A）；TSA为胰蛋白胨大豆琼脂。