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De novo transcriptome assembly in yerba mate cultivar 16318 INASE-Argentina

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NIAID Data Ecosystem2026-03-13 收录
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https://data.mendeley.com/datasets/6ww83kt8k3
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We present here two de novo transcriptome assemblies from leaves of I. paraguariensis cultivar 16318 INASE-Argentina, NCBI PRJNA251985-SRR1411087. Trinity-assembled sequences account 243,006 -[Busco embryophyta_odb10; C:87.7%(S:28.1%,D:59.6%),F:5.3%,M:7.0%]- and those assembled via rnaSPAdes account 258,352 -[Busco embryophyta_odb10; C:85.0%(S:58.3%,D:26.7%),F:7.4%,M:7.6%]-.

本研究提供两份来自阿根廷INASE机构16318号栽培品种巴拉圭冬青(I. paraguariensis)叶片的从头转录组组装结果,对应NCBI数据库登录号PRJNA251985-SRR1411087。其中经Trinity组装得到的序列共计243006条,其基于embryophyta_odb10数据库的BUSCO(Benchmarking Universal Single-Copy Orthologs)评估结果为:C:87.7%(S:28.1%,D:59.6%),F:5.3%,M:7.0%;经rnaSPAdes组装得到的序列共计258352条,其基于embryophyta_odb10数据库的BUSCO评估结果为:C:85.0%(S:58.3%,D:26.7%),F:7.4%,M:7.6%。
创建时间:
2022-05-06
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