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OryzaGenome

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国家生物信息中心2025-10-11 更新2025-03-15 收录
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http://viewer.shigen.info/oryzagenome21detail/
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官方服务:
资源简介:
OryzaGenome provides genome sequence information for 21 wild Oryza species together with several cultivated strain reference sequences. As of the OryzaGenome release 1.0, SNP information of 446 accessions of O. rufipogon is presented. Chromosome view, genome sequences and gene annotations are provided based on the latest reference Nipponbare genome, IRGSP version 1.0. Oryzabase, can serve as an excellent genotype-phenotype association resource for analyzing rice functional and structural evolution, and the associated diversity of the Oryza genus.

稻属基因组数据库(OryzaGenome)收录了21个野生稻属物种及若干栽培稻菌株的参考基因组序列信息。截至该数据库1.0版本发布时,其同步提供了446份普通野生稻(O. rufipogon)材料的单核苷酸多态性(SNP)信息。数据库的染色体浏览界面、基因组序列及基因注释均基于最新的日本晴参考基因组——国际水稻基因组测序计划(IRGSP)版本1.0进行构建与展示。配套的稻属数据库(Oryzabase)可作为优质的基因型-表型关联分析资源,用于解析水稻的功能与结构演化,以及稻属类群的相关多样性。
提供机构:
Graduate University for Advanced Studies
创建时间:
2018-01-28
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