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RBG structural bioinformatics general files

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NIAID Data Ecosystem2026-03-13 收录
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https://doi.org/10.7910/DVN/VSD9SS
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Many different files for the project including: PDB files with CONSURF with Conservation Scores in the tempFactor field (low numbers = high conservation) • protein sequences (2 folders, all formatted for DNA Strider 1.5a12) DALI results for domains predicted by ColabFold • trees - phylogeny work in iTOL and Phyml (not included in paper)

本项目包含多种类型文件,具体如下: 1. 搭载CONSURF分析结果的PDB文件,其保守性得分(Conservation Scores)存储于温度因子(tempFactor)字段中,且数值越低代表保守性越高; 2. 蛋白质序列文件(共2个文件夹,所有序列均适配DNA Strider 1.5a12格式); 3. 由ColabFold预测的蛋白质结构域对应的DALI分析结果; 4. 系统发育树相关文件——基于iTOL与Phyml完成的系统发育分析文件,该部分内容未纳入论文。
创建时间:
2022-07-06
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