Genome and Transcriptome references based on hg19 from UCSC, 2015
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rsem.transcripts.nant2015.fa.gz - bgzipped FASTA reference of transcriptomes genome.nant2015.fa.gz - bgzipped FASTA human genome reference, with several viral sequences added. refseq.txt.gz - Exact sequence accessions and mapping coordinates for a RefSeq transcriptome based off the UCSC genome browser for hg19. Coordinates are BED-style, with one row per transcript, and 1+ transcript per gene. Column annotation 1. RefSeq Accession 2. Chromosome 3. Strand 4. thinStart (gene boundary, including UTR) 5. thinEnd (gene boundary, including UTR) 6. thickStart (CDS boundary) 7. thinStart (CDS boundary) 8. number of exons 9. comma separated exon starts 10. comma separate exon ends 11. common gene name 12. refseq gene id 13. 0 if non-primary transcript, 1 if primary transcript
rsem.transcripts.nant2015.fa.gz：经bgzip压缩的转录组参考FASTA文件。 genome.nant2015.fa.gz：经bgzip压缩的人类基因组参考FASTA文件，额外添加了若干病毒序列。 refseq.txt.gz：基于UCSC基因组浏览器hg19版本构建的RefSeq转录组的精确序列登录号与映射坐标文件，已通过bgzip压缩。 该坐标采用BED格式规范，每行对应一条转录本，单个基因可对应1条及以上转录本。 各列注释详情如下： 1. RefSeq登录号（RefSeq Accession） 2. 染色体（Chromosome） 3. 链方向（Strand） 4. thinStart（基因边界，包含非翻译区UTR） 5. thinEnd（基因边界，包含非翻译区UTR） 6. thickStart（编码区CDS边界） 7. thinStart（编码区CDS边界） 8. 外显子数量 9. 逗号分隔的外显子起始位点列表 10. 逗号分隔的外显子终止位点列表 11. 通用基因名 12. RefSeq基因ID 13. 取值为0时表示非主转录本，取值为1时表示主转录本
