Expression profiling of Tex15 wt, Tex15 ht and Tex15 ko germ cells

We repport the effect of Tex15 inactivation on the transcriptome of male germ cells at embryonic day 16.5 (e16.5), 18.5 (e18.5), and postnatal day 2 (d2). We find upregulation of a large number of transposable elements in Tex15-/- germ cells. RNA-seq of Tex15 wt (d2 only), Tex15+/- and Tex15-/- male germ cells at three timepoints (e16.5, e18.5 and d2) in biological triplicates (Illumina HiSeq 4000); Germ cells were FACS-sorted (Oct4-GFP) from testes of embryos or pups from Tex15+/- x Tex15+/- matings.

本研究报道了Tex15基因失活对胚胎期16.5天（e16.5）、18.5天（e18.5）以及出生后第2天（d2）的雄性生殖细胞转录组的影响。研究发现，在Tex15基因敲除（Tex15-/-）的生殖细胞中，大量转座元件出现表达上调。本研究针对三个时间点（e16.5、e18.5及d2）的雄性生殖细胞开展RNA测序（RNA-seq），样本涵盖仅来自d2的Tex15野生型（Tex15 wt）、Tex15杂合型（Tex15+/-）以及Tex15敲除型（Tex15-/-），每组设置三次生物学重复，测序平台为Illumina HiSeq 4000；生殖细胞通过荧光激活细胞分选（FACS）从Tex15+/-与Tex15+/-交配产生的胚胎或幼崽的睾丸中分离获得，分选标记为Oct4-GFP。