input, analysis codes, and output data - Comprehensive analysis of m6A related gene mutation characteristics and prognosis in colorectal cancer

Comprehensive analysis of m6A related gene mutation characteristics and prognosis in colorectal cancer 

1) Mutation analysis of m6A regulators in CRC

maftools: Input data, R code, output 

2) M6A-related genes are enriched in regulation of mRNA metabolism process and spliceosome pathway

clusterprofiler: Input data, R code, output

3) Survival analysis of m6A gene in CRC

Cox regression and Kaplan Meier analysis: Input data, analysis code, output

4) The m6 A regulator clusters CRC into two categories 

ConsensusClusterPlus: Input data, R code, output

5) Correlation study with immune-related indicators Using the ssGSEA database and Differences in immune infiltration between the two clusters

ssGSEA: Input data, analysis code, output 

6) Stem cell index analysis

Synapser: Input data, R code, output

结直肠癌中m6A（N6-甲基腺嘌呤）相关基因突变特征与预后的综合分析

1) 结直肠癌m6A调控因子突变分析
所用工具：maftools，包含输入数据、R代码及输出结果。
2) m6A相关基因富集于mRNA代谢调控过程与剪接体通路
所用工具：clusterprofiler，包含输入数据、R代码及输出结果。
3) 结直肠癌m6A基因生存分析
采用Cox回归（Cox regression）与Kaplan-Meier分析，包含输入数据、分析代码及输出结果。
4) 基于m6A调控因子将结直肠癌分为两个亚型
所用工具：ConsensusClusterPlus，包含输入数据、R代码及输出结果。
5) 免疫相关指标关联研究
采用ssGSEA（单样本基因集富集分析，single-sample Gene Set Enrichment Analysis）开展分析，并比较两个亚型间的免疫浸润差异；所用工具：ssGSEA，包含输入数据、分析代码及输出结果。
6) 干细胞指数分析
所用工具：Synapser，包含输入数据、R代码及输出结果。