Table 1 in Complete mitochondrial genome of the terrestrial isopod Cubaris murina Brandt, 1833: new family gene order and novel tRNA secondary structures

Table 1. Arrangement and annotation of the mitochondrial genome of Cubaris murina.
LengthNameTypeStartStopStrand(bp)StartStopInter-genic spaceOverlapCox1Coding11536+1536ATGTAA1trnL2(tta)tRNA15381598+6148Cox2Coding16472282+636ATATAG2trnK(aaa)tRNA22812336+568trnD(gac)tRNA23292403+7517atp8Coding23872533+147ATATAA4atp6Coding25303192+663ATATAA2Cox3Coding31953989+795ATGTAG2trnR(cga)tRNA39884055+6855nad3Coding41114407+297ATATAA9trnA(gca)tRNA43994446+488nad1 CR putativeCoding4439 52195218 5360−780 142ATGTAG14NCR1tRNA53615429+6917rrnSrRNA54136139+72748trnW(tga)tRNA61886244+577trnS1(aga)tRNA62386296−59NCR262976666370trnL1(cta)tRNA66676731−6529cobCoding67597907−1,149ATATAG38trnT(aca)tRNA79468017−7229nad5Coding80479648+1,602ATGTAG3trnF(ttc)tRNA96469707+6215trnH(cac)tRNA96939758−6623nad4Coding973611,082−1,312ATATAA13nad4LCoding11,09611,374−279ATATAA13trnP(cca)tRNA11,36211,422−6125nad6Coding11,44811,903+456ATATAG2trnS2(tca)tRNA11,90211,962+6117rrnLrRNA11,98012,549−570NCR312,55012,753204trnE(gaa)tRNA12,75412,812−59NCR412,81312,950138trnV(gta)tRNA12,95113,019−695trnQ(caa)tRNA13,01513,077−636trnM(atg)tRNA13,07213,141+7025nad2Coding13,16714,123+978ATATAG15trnC(tgc)tRNA14,10914,158−50trnY(tac)tRNA14,15914,205−477

表1 光滑球鼠妇（Cubaris murina）线粒体基因组的排布与注释
该表格各列依次为：碱基对长度(bp)、序列名称、序列类型、基因组起始位点、基因组终止位点、转录链（"+"代表正向链，"-"代表反向互补链）、起始密码子、终止密码子、基因间隔区长度、重叠区域长度。具体条目如下：
1. 细胞色素c氧化酶亚基1（Cox1）：编码区，长度1536 bp，起始位点1，终止位点1536，转录链为正向（+），起始密码子ATG，终止密码子TAA，重叠区域长度1
2. 亮氨酸tRNA（trnL2(tta)）：转运RNA（tRNA），长度61 bp，起始位点1538，终止位点1598，转录链为正向（+），基因间隔区长度61
3. 细胞色素c氧化酶亚基2（Cox2）：编码区，长度636 bp，起始位点1647，终止位点2282，转录链为正向（+），起始密码子ATA，终止密码子TAG，重叠区域长度2
4. 赖氨酸tRNA（trnK(aaa)）：转运RNA（tRNA），长度56 bp，起始位点2281，终止位点2336，转录链为正向（+），基因间隔区长度5
5. 天冬氨酸tRNA（trnD(gac)）：转运RNA（tRNA），长度75 bp，起始位点2329，终止位点2403，转录链为正向（+），基因间隔区长度17
6. ATP合酶亚基8（atp8）：编码区，长度147 bp，起始位点2387，终止位点2533，转录链为正向（+），起始密码子ATA，终止密码子TAA，重叠区域长度4
7. ATP合酶亚基6（atp6）：编码区，长度663 bp，起始位点2530，终止位点3192，转录链为正向（+），起始密码子ATA，终止密码子TAA，重叠区域长度2
8. 细胞色素c氧化酶亚基3（Cox3）：编码区，长度795 bp，起始位点3195，终止位点3989，转录链为正向（+），起始密码子ATG，终止密码子TAG，重叠区域长度2
9. 精氨酸tRNA（trnR(cga)）：转运RNA（tRNA），长度68 bp，起始位点3988，终止位点4055，转录链为正向（+），基因间隔区长度55
10. NADH脱氢酶亚基3（nad3）：编码区，长度297 bp，起始位点4111，终止位点4407，转录链为正向（+），起始密码子ATA，终止密码子TAA，重叠区域长度9
11. 丙氨酸tRNA（trnA(gca)）：转运RNA（tRNA），长度48 bp，起始位点4399，终止位点4446，转录链为正向（+），基因间隔区长度8
12. 推定控制区：编码区，长度780 bp，起始位点4439，终止位点5219，转录链为反向（-），起始密码子ATG，终止密码子TAG，基因间隔区长度142，重叠区域长度14
13. 非编码区1（NCR1）：转运RNA（tRNA），长度69 bp，起始位点5361，终止位点5429，转录链为正向（+），基因间隔区长度17
14. 核糖体小亚基RNA（rrnS）：核糖体RNA（rRNA），长度727 bp，起始位点5413，终止位点6139，转录链为正向（+），基因间隔区长度48
15. 色氨酸tRNA（trnW(tga)）：转运RNA（tRNA），长度57 bp，起始位点6188，终止位点6244，转录链为正向（+），基因间隔区长度5
16. 丝氨酸tRNA1（trnS1(aga)）：转运RNA（tRNA），长度59 bp，起始位点6238，终止位点6296，转录链为反向（-），基因间隔区长度59
17. 非编码区2（NCR2）：序列长度370 bp，起始位点6297，终止位点6666，基因间隔区长度370
18. 亮氨酸tRNA1（trnL1(cta)）：转运RNA（tRNA），长度65 bp，起始位点6667，终止位点6731，转录链为反向（-），基因间隔区长度29
19. 细胞色素b（cob）：编码区，长度1149 bp，起始位点6759，终止位点7907，转录链为反向（-），起始密码子ATA，终止密码子TAG，重叠区域长度38
20. 苏氨酸tRNA（trnT(aca)）：转运RNA（tRNA），长度72 bp，起始位点7946，终止位点8017，转录链为反向（-），基因间隔区长度7
21. NADH脱氢酶亚基5（nad5）：编码区，长度1602 bp，起始位点8047，终止位点9648，转录链为正向（+），起始密码子ATG，终止密码子TAG，重叠区域长度3
22. 苯丙氨酸tRNA（trnF(ttc)）：转运RNA（tRNA），长度62 bp，起始位点9646，终止位点9707，转录链为正向（+），基因间隔区长度6
23. 组氨酸tRNA（trnH(cac)）：转运RNA（tRNA），长度66 bp，起始位点9693，终止位点9758，转录链为反向（-），基因间隔区长度6
24. NADH脱氢酶亚基4（nad4）：编码区，长度1312 bp，起始位点9736，终止位点11082，转录链为反向（-），起始密码子ATA，终止密码子TAA，重叠区域长度13
25. NADH脱氢酶亚基4L（nad4L）：编码区，长度279 bp，起始位点11096，终止位点11374，转录链为反向（-），起始密码子ATA，终止密码子TAA，重叠区域长度13
26. 脯氨酸tRNA（trnP(cca)）：转运RNA（tRNA），长度61 bp，起始位点11362，终止位点11422，转录链为反向（-），基因间隔区长度6
27. NADH脱氢酶亚基6（nad6）：编码区，长度456 bp，起始位点11448，终止位点11903，转录链为正向（+），起始密码子ATA，终止密码子TAG，重叠区域长度2
28. 丝氨酸tRNA2（trnS2(tca)）：转运RNA（tRNA），长度61 bp，起始位点11902，终止位点11962，转录链为正向（+），基因间隔区长度17
29. 核糖体大亚基RNA（rrnL）：核糖体RNA（rRNA），长度570 bp，起始位点11980，终止位点12549，转录链为反向（-），基因间隔区长度570
30. 非编码区3（NCR3）：序列长度204 bp，起始位点12550，终止位点12753，基因间隔区长度204
31. 谷氨酸tRNA（trnE(gaa)）：转运RNA（tRNA），长度59 bp，起始位点12754，终止位点12812，转录链为反向（-），基因间隔区长度59
32. 非编码区4（NCR4）：序列长度138 bp，起始位点12813，终止位点12950，基因间隔区长度138
33. 缬氨酸tRNA（trnV(gta)）：转运RNA（tRNA），长度69 bp，起始位点12951，终止位点13019，转录链为反向（-），基因间隔区长度6
34. 谷氨酰胺tRNA（trnQ(caa)）：转运RNA（tRNA），长度63 bp，起始位点13015，终止位点13077，转录链为反向（-），基因间隔区长度6
35. 甲硫氨酸tRNA（trnM(atg)）：转运RNA（tRNA），长度70 bp，起始位点13072，终止位点13141，转录链为正向（+），基因间隔区长度25
36. NADH脱氢酶亚基2（nad2）：编码区，长度978 bp，起始位点13167，终止位点14123，转录链为正向（+），起始密码子ATA，终止密码子TAA，重叠区域长度15
37. 半胱氨酸tRNA（trnC(tgc)）：转运RNA（tRNA），长度50 bp，起始位点14109，终止位点14158，转录链为反向（-），基因间隔区长度50
38. 酪氨酸tRNA（trnY(tac)）：转运RNA（tRNA），长度47 bp，起始位点14159，终止位点14205，转录链为反向（-），基因间隔区长度77