Differential transcript usage in the Parkinson's disease brain
收藏DataCite Commons2025-05-01 更新2024-08-17 收录
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资源简介：
Raw data and findings of:<b>"Differential transcript usage in the Parkinson's disease brain".</b>Code to reproduce findings at: https://github.com/fifdick/DTUinPDbrain<br>- "DTU_events.txt" contains result statistics of both DRIMSeq and DEXSeq for all transcripts- "TPM_mat.txt" contains TPMs (after using tximport) for all transcripts. Additional column indicates whether the transcript was removed from further down-stream analysis or survived pre-filtering-"sample_info.txt" contains the meta-data file used to run the DTU analysis with the code provided. (Covariates and condition)<br>
本数据集包含《帕金森病大脑中的转录本差异使用（Differential transcript usage）》相关的原始数据与研究成果。复现该研究结果的代码仓库地址：https://github.com/fifdick/DTUinPDbrain
- `DTU_events.txt`：收录所有转录本的DRIMSeq与DEXSeq分析结果统计数据
- `TPM_mat.txt`：包含所有转录本的每百万转录本数（Transcripts Per Million，TPM，经tximport工具处理后）的数值，新增一列用于标注该转录本是否被排除于后续下游分析，或是通过预过滤保留至后续分析
- `sample_info.txt`：为元数据文件，用于配合提供的代码执行转录本差异使用分析，其中包含协变量与实验分组信息
提供机构：
figshare
创建时间：
2020-09-11
