Accession numbers for sequences generated from hydrothermal plume samples collected on R/V New Horizon cruises GoCAL1, GoCAL2, GoCAL3 in the Guaymas Basin, Gulf of California from 2005-2014 (Guaymas plumes project)

<p>Accession numbers and links are provided for DNA sequence data. Samples were collected in the Guaymas and Carmen Basins, Gulf of California.</p>

<p><em>The following publications are associated with this data:</em><br />
Anantharaman, K.A., M.B. Duhaime, J.A. Breier, K. Wendt, B.M. Toner, and G.J. Dick (2014). Sulfur oxidation genes in diverse deep-sea viruses. Science 344: 757-760. doi:<a href=\"http://dx.doi.org/10.1126/science.1252229\" target=\"_blank\">10.1126/science.1252229 </a></p>

<p>Li, M., B.M. Toner, B.J. Baker, J.A. Breier, C.S. Sheik, and G.J. Dick (2014). Microbial iron uptake as a mechanism for dispersing iron from deep-sea hydrothermal vents. Nature Communications 5: 3192. doi:<a href=\"http://dx.doi.org/10.1038/ncomms4192\" target=\"_blank\">10.1038/ncomms4192</a></p>

<p>Li, M., S. Jain, B.J. Baker, C. Taylor, and G.J. Dick (2014). Novel hydrocarbon monooxygenase genes in the metatranscriptome of a natural deep-sea hydrocarbon plume. Environmental Microbiology 16: 60-71. doi:<a href=\"http://dx.doi.org/10.1111/1462-2920.12182\" target=\"_blank\">10.1111/1462-2920.12182</a></p>

<p>Sheik, C.S. 2, S. Jain, and G.J. Dick (2014). Metabolic flexibility of enigmatic SAR324 revealed through metagenomics and metatranscriptomics. Environmental Microbiology 16: 304-317. doi:<a href=\"http://dx.doi.org/10.1111/1462-2920.12165\" target=\"_blank\">10.1111/1462-2920.12165</a></p>

<p>Baker, B.J., C.S. Sheik, C.A. Taylor, S. Jain, A. Bhasi, J.D. Cavalcoli, and G.J. Dick (2013). Community transcriptomic assembly reveals microbes that contribute to deep-sea carbon and nitrogen cycling. The ISME Journal 7: 1962-1973. doi:<a href=\"http://dx.doi.org/10.1038/ismej.2013.85\" target=\"_blank\">10.1038/ismej.2013.85</a></p>

<p>Dick, G.J., K. Anantharaman, B.J. Baker, M. Li, D.C. Reed, and C.S. Sheik (2013). Hydrothermal vent plume microbiology: ecological and biogeographic linkages to seafloor and water column habitats. Frontiers in Microbiology 4: 124. doi:<a href=\"http://dx.doi.org/10.3389/fmicb.2013.00124\" target=\"_blank\">10.3389/fmicb.2013.00124 </a></p>

<p>Anantharaman, K., J.A. Breier, C.S. Sheik, and G.J. Dick (2013). Evidence for hydrogen oxidation and metabolic plasticity in widespread deep-sea bacteria. Proceedings of the National Academy of Sciences 110: 330-335. doi:<a href=\"http://dx.doi.org/10.1073/pnas.1215340110\" target=\"_blank\">10.1073/pnas.1215340110</a></p>

<p>Baker, B.J., R.A. Lesniewski, and G.J. Dick. Genome-enabled transcriptomics reveals archaeal populations that drive nitrification in a deep-sea hydrothermal plume (2012). The ISME Journal 6: 2269-2279. doi:<a href=\"http://dx.doi.org/10.1038/ismej.2012.64\" target=\"_blank\">10.1038/ismej.2012.64</a></p>

<p>Lesniewski, R.A., S. Jain, P.D. Schloss, K. Anantharaman,and G.J. Dick (2012). The metatranscriptome of a deep-sea hydrothermal plume is dominated by water column methanotrophs and chemolithotrophs. The ISME Journal 6: 2257-2268. doi:<a href=\"http://dx.doi.org/10.1038/ismej.2012.63\" target=\"_blank\">10.1038/ismej.2012.63</a></p>

<p>本数据集提供了DNA序列数据的登录号与下载链接。样本采集自加利福尼亚湾的瓜伊马斯盆地（Guaymas Basin）与卡门盆地（Carmen Basin）。</p>

<p><em>本数据集关联的已发表文献如下：</em><br />
阿纳塔拉曼（Anantharaman, K.A.）、杜海姆（Duhaime, M.B.）、布雷耶（Breier, J.A.）、温特（Wendt, K.）、托纳（Toner, B.M.）与迪克（Dick, G.J.）（2014）. 《不同深海病毒中的硫氧化基因》，《科学》，344卷：757-760. DOI：<a href="http://dx.doi.org/10.1126/science.1252229" target="_blank">10.1126/science.1252229</a></p>

<p>李（Li, M.）、托纳（Toner, B.M.）、贝克（Baker, B.J.）、布雷耶（Breier, J.A.）、谢克（Sheik, C.S.）与迪克（Dick, G.J.）（2014）. 《微生物摄铁作为深海热液喷口铁扩散的机制》，《自然-通讯》，5卷：3192. DOI：<a href="http://dx.doi.org/10.1038/ncomms4192" target="_blank">10.1038/ncomms4192</a></p>

<p>李（Li, M.）、贾恩（Jain, S.）、贝克（Baker, B.J.）、泰勒（Taylor, C.）与迪克（Dick, G.J.）（2014）. 《天然深海烃类羽流宏转录组（metatranscriptome）中的新型烃单加氧酶基因》，《环境微生物学》，16卷：60-71. DOI：<a href="http://dx.doi.org/10.1111/1462-2920.12182" target="_blank">10.1111/1462-2920.12182</a></p>

<p>谢克（Sheik, C.S.）、贾恩（Jain, S.）与迪克（Dick, G.J.）（2014）. 《通过宏基因组学（metagenomics）与宏转录组学（metatranscriptomics）揭示神秘SAR324类群的代谢灵活性》，《环境微生物学》，16卷：304-317. DOI：<a href="http://dx.doi.org/10.1111/1462-2920.12165" target="_blank">10.1111/1462-2920.12165</a></p>

<p>贝克（Baker, B.J.）、谢克（Sheik, C.S.）、泰勒（Taylor, C.A.）、贾恩（Jain, S.）、巴希（Bhasi, A.）、卡瓦尔科利（Cavalcoli, J.D.）与迪克（Dick, G.J.）（2013）. 《群落转录组组装揭示参与深海碳氮循环的微生物类群》，《ISME杂志》，7卷：1962-1973. DOI：<a href="http://dx.doi.org/10.1038/ismej.2013.85" target="_blank">10.1038/ismej.2013.85</a></p>

<p>迪克（Dick, G.J.）、阿纳塔拉曼（Anantharaman, K.）、贝克（Baker, B.J.）、李（Li, M.）、里德（Reed, D.C.）与谢克（Sheik, C.S.）（2013）. 《热液喷口羽流微生物学：与海底及水体生境的生态与生物地理关联》，《微生物学前沿》，4卷：124. DOI：<a href="http://dx.doi.org/10.3389/fmicb.2013.00124" target="_blank">10.3389/fmicb.2013.00124</a></p>

<p>阿纳塔拉曼（Anantharaman, K.）、布雷耶（Breier, J.A.）、谢克（Sheik, C.S.）与迪克（Dick, G.J.）（2013）. 《广泛分布的深海细菌的氢氧化作用与代谢可塑性证据》，《美国国家科学院院刊》，110卷：330-335. DOI：<a href="http://dx.doi.org/10.1073/pnas.1215340110" target="_blank">10.1073/pnas.1215340110</a></p>

<p>贝克（Baker, B.J.）、莱斯涅夫斯基（Lesniewski, R.A.）与迪克（Dick, G.J.）（2012）. 《基于基因组的转录组学揭示驱动深海热液羽流硝化作用（nitrification）的古菌种群》，《ISME杂志》，6卷：2269-2279. DOI：<a href="http://dx.doi.org/10.1038/ismej.2012.64" target="_blank">10.1038/ismej.2012.64</a></p>

<p>莱斯涅夫斯基（Lesniewski, R.A.）、贾恩（Jain, S.）、施洛斯（Schloss, P.D.）、阿纳塔拉曼（Anantharaman, K.）与迪克（Dick, G.J.）（2012）. 《深海热液羽流宏转录组（metatranscriptome）以水体甲烷氧化菌（methanotrophs）与化能自养菌（chemolithotrophs）为主》，《ISME杂志》，6卷：2257-2268. DOI：<a href="http://dx.doi.org/10.1038/ismej.2012.63" target="_blank">10.1038/ismej.2012.63</a></p>