Eukaryotic 18S SSU rRNA V4 molecular diversity observed in three Austrian lakes

Eukaryotic 18S SSU rRNA V4 molecular diversity observed in three Austrian lakes in 2006 (lakes Augstsee, Fuschlsee, and Wallersee) and 2007 (lake Fuschlsee). The primers used focus on diatoms and go back to primers suggested by Jonas Zimmermann, in practice they target large groups of Stramenopiles: forward primer: 5'-ATTCCAGCTCCAATAGCG-3', reverse primer: 5'-GACTACGATGGTATCTAATC-3'. Roche 454 sequencing, project supervised by Jens Boenigk.

本数据集为2006年对奥地利3个湖泊（奥格斯特湖Augstsee、富施尔湖Fuschlsee、瓦勒尔塞湖Wallersee）以及2007年对富施尔湖的真核生物18S小亚基核糖体RNA（18S SSU rRNA）V4可变区分子多样性的观测结果。所用引物针对硅藻设计，其原型源自乔纳斯·齐默尔曼（Jonas Zimmermann）提出的引物序列，实际可靶向覆盖一大类不等鞭毛类（Stramenopiles）生物：正向引物序列为5'-ATTCCAGCTCCAATAGCG-3'，反向引物序列为5'-GACTACGATGGTATCTAATC-3'。该数据集采用罗氏454（Roche 454）测序技术生成，项目由延斯·伯尼格（Jens Boenigk）负责监督。