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Short reads comparison (with mate-pairs).

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NIAID Data Ecosystem2026-03-07 收录
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https://figshare.com/articles/dataset/_Short_reads_comparison_with_mate_pairs_/450077
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资源简介:
Short reads assembly comparison using mate-pair information. First and second columns report the genome and assembler name; columns 3 to 7 report the contig size statistics, specifically: number of contigs, number of contigs with size , max contig size, mean contig size, and N50 size (N50 is the largest number such that the combined length of all contigs of length is at least 50% of the total length of all contigs). Finally column 8 reports the coverage achieved by all the contigs.

基于配对末端测序(mate-pair)信息的短读长组装结果对比。第1、2列分别记录基因组名称与组装工具名称;第3至7列为重叠群(contig)长度统计信息,具体包括:重叠群总数、特定长度重叠群数量、最大重叠群长度、平均重叠群长度以及N50值(N50指满足所有长度不小于该值的重叠群总长度至少占全部重叠群总长度50%的最大数值)。最后一列记录所有重叠群的测序覆盖度。
创建时间:
2011-04-29
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