遇见数据集

SSR data for Didymella tanaceti 2012 Tasmanian Population

收藏
Figshare2018-10-22 更新2026-04-08 收录
官方服务:

资源简介:

.csv file of SSR allele repeat numbers for a <i>Didymella tanaceti </i>population collected in 2012 from Tasmania, Australia. <br>Data is in Genalex format for upload into R program Poppr<br>Isolate column contains code for each individual isolate in population.<br>Pop column indicates the hierarchies which were used for analysis (1_2_3_4_5_6)1: TAS = overall population2: AUG/NOV = sampling time; AUG = August sampling, NOV = November sampling3: SASS/TABLE = location of field; SASS = Sassafrass Tasmania, TABLE = Table Cape Tasmania4: 51907/63242/70047/70046 = field sampled5: 1/2 = Transect sampled in field6: 1/2 = Mating-type of isolate; 1 = Mat1-1, 2 = Mat1-2<br>SSR details are contained in Table 1. <br>

本数据集为2012年采自澳大利亚塔斯马尼亚州的除虫菊壳二孢(Didymella tanaceti)种群的简单序列重复(SSR,Simple Sequence Repeat)等位基因重复数.csv格式文件。数据采用Genalex格式存储,可直接上传至R语言程序Poppr中。数据中的Isolate(分离株编号)列包含该种群中每个单株分离株的编码。Pop(种群)列用于标注分析所用的层级结构,其编码格式为1_2_3_4_5_6,各分段含义如下:1. 第一位(1):TAS代表整体种群;2. 第二位(2):AUG/NOV代表采样时间,其中AUG为8月采样,NOV为11月采样;3. 第三位(3):SASS/TABLE代表试验田位置,其中SASS为塔斯马尼亚州萨斯弗雷什(Sassafrass),TABLE为塔斯马尼亚州塔布尔角(Table Cape);4. 第四位(4):51907/63242/70047/70046为具体采样的试验田编号;5. 第五位(5):1/2为该试验田内的样带编号;6. 第六位(6):1/2为分离株的交配型,其中1对应Mat1-1,2对应Mat1-2。简单序列重复(SSR)的详细信息参见表1。

提供机构:
Tamieka Pearce
创建时间:
2018-10-22
二维码
社区交流群
二维码
科研交流群
商业服务