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NUCmer summary table of DNA rearrangement between Ld1S and LBPK282A1.

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Figshare2026-03-06 更新2026-04-28 收录
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资源简介:

Columns are: SEQ, the Ld1S sequence ID; TYPE, event class; S1/E1, 1-based start and end coordinates on SEQ; LEN 1, event size on SEQ (negative values indicate reverse orientation). Event codes: BRK (alignment break), GAP (insertion/deletion between blocks), DUP (local/tandem duplication), INV (inversion), JMP (relocation/translocation “jump” between non-syntenic blocks), and SEQ (sequence-to-sequence junction reported by the aligner). Coordinates are reported in the coordinate system of SEQ; signs reflect orientation. (XLSX)

数据集各列说明如下:SEQ为Ld1S序列标识符;TYPE为事件类别;S1/E1分别为SEQ上基于1的起始与终止坐标;LEN 1为SEQ上的事件长度(负值表示序列反向方向)。事件编码包括:BRK(比对断裂)、GAP(区块间插入/缺失)、DUP(局部/串联重复)、INV(倒位)、JMP(非共线性区块间的重定位/易位“跳跃”)以及SEQ(比对工具报告的序列间连接位点)。坐标采用SEQ所属的坐标系;符号用于反映序列方向。(XLSX)

创建时间:
2026-03-06
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