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Frankliniella occidentalis genome annotations v0.5.3

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NIAID Data Ecosystem2026-04-25 收录
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https://figshare.com/articles/dataset/Frankliniella_occidentalis_genome_annotations_v0_5_3/24852708
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资源简介:
This dataset presents the Frankliniella occidentalis gene set BCM_v_0.5.3. RNA-Seq data was used with additional protein homology data for a MAKER automated annotation of the Frankliniella occidentalis genome assembly 1.0. If you wish to use this dataset, please follow the Baylor College of Medicine's conditions for data use. Resources in this dataset: Resource Title: Frankliniella occidentalis genome annotations v0.5.3 for genome assembly v1.0. File Name: fraocc_BCM_version_0.5.3.tar.gz Resource Description: The attached tar.gz archive (FOCC_BCM_version_0.5.3.tar.gz) contains the following files: FOCC.CDS.fna. CDS sequences of Frankliniella occidentalis genome annotations v0.5.3. FOCC.faa. Amino acid sequences of Frankliniella occidentalis genome annotations v0.5.3. FOCC.fna. cDNA sequences of Frankliniella occidentalis genome annotations v0.5.3. FOCC.Models.gff3. Gff3 of all gene predictions of Frankliniella occidentalis genome annotations v0.5.3. FOCC.Analysis.gff3 Gff3 of all evidence contributing to Frankliniella occidentalis genome annotations v0.5.3.

本数据集收录西花蓟马(Frankliniella occidentalis)BCM_v_0.5.3基因集。本研究结合RNA测序(RNA-Seq)数据与额外蛋白质同源性数据,借助MAKER自动化注释流程,对西花蓟马基因组组装版本1.0完成注释。若需使用本数据集,请遵循贝勒医学院(Baylor College of Medicine)的数据使用规范。 本数据集包含以下资源: 资源标题:适配基因组组装v1.0的西花蓟马基因组注释v0.5.3 文件名:fraocc_BCM_version_0.5.3.tar.gz 资源描述:所附tar.gz压缩归档文件(FOCC_BCM_version_0.5.3.tar.gz)包含以下文件: FOCC.CDS.fna:西花蓟马基因组注释v0.5.3的编码序列(CDS)核苷酸序列 FOCC.faa:西花蓟马基因组注释v0.5.3的氨基酸序列 FOCC.fna:西花蓟马基因组注释v0.5.3的互补DNA(cDNA)序列 FOCC.Models.gff3:西花蓟马基因组注释v0.5.3所有基因预测结果的GFF3格式注释文件 FOCC.Analysis.gff3:支撑西花蓟马基因组注释v0.5.3的全部证据对应的GFF3格式注释文件
创建时间:
2019-06-20
5,000+
优质数据集
54 个
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