berglund2018spatial_ST_prostate

berglund2018spatial_ST_prostate is a spatial transcriptomics datasets, published with a study investigating tissue-wide gene expression heterogeneity throughout a multifocal prostate cancer using the spatial transcriptomics (ST) technology12. There are 14 sub-datasets in ST_ melanoma, which contains triplicates from 4 prostate cancer patients and two extra sample from patient2 and patient3. The number of spots for the 14 sub-datasets with ~17000 gene expression features are 432 (P1.1), 406 (P1.2), 629 (P1.3), 547 (P2.1), 506 (Patient2_E2), 483 (P2.3), 448 (P2.4), 627 (P3.1), 523 (P3.2), 501 (P3.3), 244(Patient3_D1), 688 (P4.1), 324 (P4.2) and 302 (P4.3). The count matrix of berglund2018spatial_ST_prostate dataset was downloaded from https://www.spatialresearch.org/resources-published-datasets/.

berglund2018spatial_ST_prostate 是一个空间转录组（spatial transcriptomics，ST）数据集，该数据集随一项研究共同发表，该项研究利用空间转录组（ST）技术，探究了多灶性前列腺癌全组织范围内的基因表达异质性。ST_黑色素瘤数据集包含14个子数据集，涵盖4名前列腺癌患者的3次生物学重复样本各1组，另包含来自患者2与患者3的额外样本各1份。上述14个子数据集均包含约17000个基因表达特征，各子数据集的空间捕获位点数量分别为：432（P1.1）、406（P1.2）、629（P1.3）、547（P2.1）、506（Patient2_E2）、483（P2.3）、448（P2.4）、627（P3.1）、523（P3.2）、501（P3.3）、244（Patient3_D1）、688（P4.1）、324（P4.2）及302（P4.3）。berglund2018spatial_ST_prostate数据集的计数矩阵可从https://www.spatialresearch.org/resources-published-datasets/下载获取。