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Additional file 1 of Whole-genome association analyses of sleep-disordered breathing phenotypes in the NHLBI TOPMed program

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DataCite Commons2024-02-13 更新2024-07-28 收录
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Additional file 1: Table S1. NHLBI TOPMed Consortium. Table S2. NHLBI TOPMed Consortium Sleep Working Group. Table S3. Pairwise Phenotype and Covariate Correlations. Table S4. MMSKAT gene-based multiple-population results (p < 0.01). Table S5. MMSKAT gene-based population-specific results (p < 0.01). Table S6. Lead MMSKAT result variants. Table S7. Single-variant analysis results for lead loci. Table S8. Lookups of previously reported GWAS results. Table S9. MetaXcan imputed gene expression results. Table S10. Lead genes in multiple MetaXcan results. Table S11. GIGSEA KEGG pathway results. Table S12. GIGSEA MsigDB transcription factor binding site enrichment results. Table S13. GIGSEA MsigDB miRNA binding site enrichment results. Table S14. Sliding window analysis transcription factor binding analysis enrichment. Table S15. Lead sliding window analysis results.

补充文件1:附表S1。美国国立心肺血液研究所(National Heart, Lung, and Blood Institute, NHLBI)TOPMed联盟。 附表S2。NHLBI TOPMed联盟睡眠工作组。 附表S3。表型与协变量两两相关性分析结果。 附表S4。基于基因的多人群MMSKAT分析结果(p<0.01)。 附表S5。基于基因的人群特异性MMSKAT分析结果(p<0.01)。 附表S6。MMSKAT分析核心结果变异位点。 附表S7。核心位点的单变异分析结果。 附表S8。既往已发表的全基因组关联研究(Genome-Wide Association Study, GWAS)结果检索表。 附表S9。MetaXcan推算基因表达量分析结果。 附表S10。多组MetaXcan分析结果中的核心基因。 附表S11。GIGSEA分析KEGG通路富集结果。 附表S12。GIGSEA分析分子特征数据库(Molecular Signatures Database, MsigDB)转录因子结合位点富集结果。 附表S13。GIGSEA分析MsigDB微小RNA(microRNA, miRNA)结合位点富集结果。 附表S14。滑动窗口转录因子结合富集分析结果。 附表S15。滑动窗口分析核心结果。
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创建时间:
2021-08-27
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