hipsci_peptide_qtls
收藏DataCite Commons2020-08-25 更新2024-07-28 收录
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Dataset corresponding to the article "Population-scale proteome variation in human induced pluripotent stem cells". peptideQTL (associations performed at peptide resolution using peptide intensities and aggregated at gene level) mapping performed on GRCh37 using 202 IPS cell lines. <br><br> This h5 file is organised as follows:<pre><code>| feature_id | + data [#fields, #SNP] {'snp_id', 'number_samples','beta','p_value '}</code></pre>
本数据集对应学术论文《Population-scale proteome variation in human induced pluripotent stem cells》（人诱导多能干细胞的群体规模蛋白质组变异）。本研究以20株诱导多能干细胞（induced pluripotent stem cell, IPS）系为研究材料，在GRCh37参考基因组上开展了肽数量性状位点（peptideQTL）定位分析：该分析以肽段强度为基础，在肽段分辨率下执行关联检验，并将结果聚合至基因层面。<br><br>该H5文件的组织结构如下：<pre><code>| feature_id | + data [#fields, #SNP] {'snp_id', 'number_samples','beta','p_value '}</code></pre>
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创建时间：
2020-07-16
