CRdb

CRdb curates a large number of available resources for CRs and providing extensive annotations and analyses of CRs to help biological researchers clarify the regulation mechanism and function of CRs. The CRdb database comprised a total of 647 CRs and 2,591 ChIP-seq samples from more than 300 human tissues and cell types. These samples have been manually curated from NCBI GEO/SRA and ENCODE.CRdb 收录了大量面向顺式调控元件（cis-regulatory elements，CRs）的可用资源，并针对CRs提供了全面的注释与分析，以助力生物科研人员阐明CRs的调控机制与功能。该数据库共包含647个顺式调控元件与2591个染色质免疫共沉淀测序（Chromatin Immunoprecipitation sequencing，ChIP-seq）样本，覆盖超过300种人类组织与细胞类型。所有样本均从美国国家生物技术信息中心基因表达综合数据库/序列读取存档（NCBI GEO/SRA）与DNA元件百科全书（Encyclopedia of DNA Elements，ENCODE）中人工整理得到。

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

CRdb是一个综合的人类染色质调节因子数据库，收录了647个CRs和2591个相关ChIP-seq样本，数据来源于300多种人类组织和细胞类型，并经过手动整理。该数据库提供广泛的CR注释和多种分析功能，旨在帮助研究人员阐明CRs的调控机制和功能。