R scripts and data for SIBER analysis of Benthic trophic interactions and glacier retreat

R scripts for SIBER analysis and Graphs These are the R and Rmd (R markdown) scripts used in the paper: Pasotti F, Saravia LA, De Troch M, Tarantelli MS, Sahade R, Vanreusel A. Benthic trophic interactions in an Antarctic shallow water ecosystem affected by recent glacier retreat. PLoS One. 2015;10: e0141742. doi:10.1371/journal. pone.0141742 Description of main files: Siber.Rmd: R markdown file used for the analysis and figures of the complete original data. Siber_wout_MT2-poly.Rmd: Small modifications to analyze a data set without some outliers of the same data. Pasotti.dat: original data used in the analysis Accesory files: BUGS_models.r/SEA_fitting.r: updated functions for SIBER analysis not included in the package Test simul_ln_iso_data.r: generation of simulated data pasottiSim.dat: Simulated data Siber_w_sim_data.Rmd: sligtly modified R script to run with simulated data

用于SIBER分析与绘图的R脚本。本数据集为论文《近期冰川消退影响下南极浅海生态系统的底栖营养相互作用》所用的R及Rmd（R Markdown）脚本，作者为Pasotti F、Saravia LA、De Troch M、Tarantelli MS、Sahade R、Vanreusel A，发表于PLoS One，2015年，10卷：e0141742，DOI: 10.1371/journal.pone.0141742。
主要文件说明：
Siber.Rmd：用于完整原始数据的分析与绘图的R Markdown文件。
Siber_wout_MT2-poly.Rmd：针对该数据集剔除部分异常值后开展分析的小幅修改版脚本。
Pasotti.dat：本次分析所用的原始数据文件。
附属文件：
BUGS_models.r/SEA_fitting.r：SIBER分析的更新函数，未包含于官方工具包中。
Test_simul_ln_iso_data.r：模拟同位素数据的生成脚本。
pasottiSim.dat：模拟生成的数据文件。
Siber_w_sim_data.Rmd：针对模拟数据运行分析的小幅修改版R脚本。