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Adaptive introgression outliers.

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Figshare2021-09-27 更新2026-04-28 收录
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https://figshare.com/articles/dataset/Adaptive_introgression_outliers_/16688457
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1000 SNPs had outlier values for all three introgression statistics: RD, Q95, and U20. Columns 1–13 are: 1) Chromosome; 2) Position; 3) rsID; 4) GTEx SNP ID. "NA" indicates the SNP is not an eQTL in GTEx; 5) Modern human allele; 6) Neanderthal allele; 7) Neanderthal allele frequency, 8) Ensembl gene id, 9) Gene symbol, 10) 50 kb genomic window where SNP resides, 11) RD statistic, 12) Q95 statistic, 13) U20 statistic. (TXT)

共有1000个单核苷酸多态性(Single Nucleotide Polymorphism,SNP)在RD、Q95和U20这三个渐渗统计量中均呈现异常值。该数据集的第1至13列依次对应如下信息:1) 染色体;2) 基因组位置;3) rsID;4) GTEx(Genotype-Tissue Expression)数据库SNP编号,其中“NA”表示该SNP在GTEx数据库中不属于表达数量性状基因座(expression Quantitative Trait Locus, eQTL);5) 现代人等位基因;6) 尼安德特人等位基因;7) 尼安德特人等位基因频率;8) Ensembl基因编号;9) 基因符号;10) 该SNP所在的50 kb基因组窗口;11) RD统计量;12) Q95统计量;13) U20统计量。(TXT格式)
创建时间:
2021-09-27
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