Set Simulations Small Pure Bilayers (72 Lipids) Using Charmm36 Ff In Gromacs (Dppc, Popc)
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Collection simulations of DPPC and POPC bilayers in gromacs using the charmm36 force field. The list of systems describing their particular simulation conditions can be found below: 1) DPPC_72_325K (500ns)<br> 2) DPPC_72_310K_rmcomm_leaflets (500ns)<br> 3) DPPC_72_310K_rmcomm_leaflets_low_hydration (500ns)<br> 4) POPC_72_310K (500ns)<br> 5) POPC_72_310K_rmcomm_leaflets (500ns)<br> 6) POPC_72_310K_rmcomm_leaflets_low_hydration (550ns)<br> 7) POPC_72_303K_rmcomm_leaflets_low_hydration (550ns) For further information read the Readme file provided for each simulation.
本数据集收录了采用CHARMM36力场(CHARMM36 force field)、依托GROMACS(GROMACS)分子模拟软件完成的二棕榈酰磷脂酰胆碱(DPPC)与1-棕榈酰-2-油酰磷脂酰胆碱(POPC)双层磷脂膜分子动力学模拟任务。各模拟体系的具体模拟条件列表如下: 1) DPPC_72_325K(模拟时长500ns) 2) DPPC_72_310K_rmcomm_leaflets(模拟时长500ns) 3) DPPC_72_310K_rmcomm_leaflets_low_hydration(模拟时长500ns) 4) POPC_72_310K(模拟时长500ns) 5) POPC_72_310K_rmcomm_leaflets(模拟时长500ns) 6) POPC_72_310K_rmcomm_leaflets_low_hydration(模拟时长550ns) 7) POPC_72_303K_rmcomm_leaflets_low_hydration(模拟时长550ns) 如需获取更多详细信息,请查阅各模拟任务配套的Readme文档。



