cao_esophageal_wgbs_hg19
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A HDF5-backed RangedSummarizedExperiment for WGBS Data (hg19 CpG sites) for 10 esophageal cancer tumours and 9 matching normal esophageal samples from the paper 'Cao, Wei, et al. "Multi-faceted epigenetic dysregulation of gene expression promotes esophageal squamous cell carcinoma." <em>Nature communications</em> 11.1 (2020): 3675.'.
本数据集为一款以分层数据格式5(Hierarchical Data Format 5, HDF5)为后端存储的区间汇总实验对象(RangedSummarizedExperiment),用于存储全基因组亚硫酸氢盐测序(Whole Genome Bisulfite Sequencing, WGBS)数据,其覆盖hg19参考基因组的CpG位点,包含10例食管肿瘤组织样本与9例匹配的正常食管组织样本,相关数据源自曹伟等人发表于《自然-通讯》(Nature Communications)2020年第11卷第1期第3675页的研究论文《多维度表观遗传调控异常驱动食管鳞状细胞癌发生》。
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Zenodo创建时间:
2023-10-06



