OrtholugeDB

OrtholugeDB contains Ortholuge-based orthology predictions for completely sequenced bacterial and archaeal genomes. It is also a resource for reciprocal best BLAST-based ortholog predictions, in-paralog predictions (recently duplicated genes) and ortholog groups in Bacteria and Archaea. The Ortholuge method improves the specificity of high-throughput orthology prediction.

OrtholugeDB 收录基于Ortholuge算法的已完成全基因组测序的细菌与古菌基因组直系同源（orthology）预测结果。该数据库同时提供基于双向最佳BLAST（reciprocal best BLAST）的直系同源物预测、近源旁系同源（in-paralog，近期复制基因）预测，以及细菌与古菌的直系同源基因簇数据资源。Ortholuge算法可提升高通量直系同源预测的特异性。

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

OrtholugeDB是一个针对已完成测序的细菌和古菌基因组的同源关系预测数据库，其基于Ortholuge方法提高了高通量同源性预测的特异性。该数据库还包含基于互惠最佳命中的同源物预测、旁系同源物预测以及同源物分组信息，并提供多基因组比较、双基因组间同源物查询等分析功能。