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counts

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Figshare2020-04-24 更新2026-04-28 收录
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tblcounts_asv_melt.csv: A melted table containingthe sequence counts of each ASV detected in 12,546 stool samples SampleID: stool sample identifier ASV: identifier of the ASVs Count: number of reads tblqpcr.csv: 16S rRNA qPCR data for 3,342 stool samples SampleID: stool sample identifier qPCR16S: 16S copies per gram of stool sampletblcounts_{asv,genus,family,order,class,phylum}_wide.csv: Wide-format taxa-by-sample table of counts at different taxonomic levels

tblcounts_asv_melt.csv:该长格式数据表包含12546份粪便样本中检出的每一个扩增子序列变异体(Amplicon Sequence Variant,ASV)的序列计数信息,相关字段说明如下:SampleID为粪便样本标识符,ASV为扩增子序列变异体的标识符,Count为测序读段的数量。 tblqpcr.csv:该数据集包含3342份粪便样本的16S rRNA定量聚合酶链式反应(qPCR)数据,相关字段说明如下:SampleID为粪便样本标识符,qPCR16S为每克粪便样本中的16S拷贝数。 tblcounts_{asv,genus,family,order,class,phylum}_wide.csv:该宽格式数据表为不同分类学层级下的分类单元-样本计数矩阵,涵盖的分类层级依次为扩增子序列变异体(ASV)、属、科、目、纲、门。

创建时间:
2020-04-24
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