Mill C assemblies
收藏资源简介:
Fasta files of assemblies of samples from Mill C. (metaspades mode; (4)), (5) andAssemblies done using IDBA-UD v.1.1.3: MillC_170825-idbaud-contigs-prefix-formatted-only.fa, MillC_171204-idbaud-contigs-prefix-formatted-only.fa, MillC-coassembly-idbaud-contigs-prefix-formatted-only.faAssemblies done using MEGAHIT v. 1.2.9: MillC_170825-mgh-contigs-prefix-formatted-only.fa, MillC-171204-mgh-contigs-prefix-formatted-only.fa, MillC-coassembly-mgh-contigs-prefix-formatted-only.faAssemblies done using SPAdes v. 3.12.0: MillC_171204msp_contigs.fa, MillC-msp-coassembly-contigs-prefix-formatted-only.fa
本数据集包含两类FASTA格式文件的组装结果:其一为源自Mill C.的样本组装产物,采用metaSPAdes组装模式完成(参考文献(4)、(5));其二为使用三款不同组装软件得到的组装结果,具体如下: 1. 使用IDBA-UD v.1.1.3组装得到的对应文件:MillC_170825-idbaud-contigs-prefix-formatted-only.fa、MillC_171204-idbaud-contigs-prefix-formatted-only.fa、MillC-coassembly-idbaud-contigs-prefix-formatted-only.fa 2. 使用MEGAHIT v.1.2.9组装得到的对应文件:MillC_170825-mgh-contigs-prefix-formatted-only.fa、MillC-171204-mgh-contigs-prefix-formatted-only.fa、MillC-coassembly-mgh-contigs-prefix-formatted-only.fa 3. 使用SPAdes v.3.12.0组装得到的对应文件:MillC_171204msp_contigs.fa、MillC-msp-coassembly-contigs-prefix-formatted-only.fa



