Supplementary data for: Evolutionary rates of nuclear and organellar genomes are linked in land plants

Supplementary data for: Evolutionary rates of nuclear and organellar genomes are linked in land plants. Main Supplementary Files.zip: Alignments, tree topologies, maximum-likelihood and Bayesian trees, and output log files from analyses. All empirical analyses from main text included (mosses, ferns, gymnosperms, and angiosperms). SI Simulation Study Files.zip: Phylograms, synthetic data sets, BEAST2 XML files, maximum-likelihood and Bayesian trees, and results for tests for correlations for all simulation conditions. SI Saturation Tests.zip: Results of saturation tests using PhyloMAd (Dûchene et al. 2018). SI Sub-Sampling Files.zip: Alignments, tree topologies, maximum-likelihood and Bayesian trees, and output log files from sub-sampling angiosperms. Full details of methods and results provided in SI.本补充数据配套论文：《陆生植物细胞核与细胞器基因组的进化速率存在关联》 主补充文件包（Main Supplementary Files.zip）：包含序列联配（Alignments）、系统发育拓扑结构（Tree Topologies）、最大似然树（Maximum-Likelihood Trees）与贝叶斯树（Bayesian Trees），以及各类分析的输出日志文件。本包涵盖正文中所有实证分析相关数据，涉及苔藓（Mosses）、蕨类（Ferns）、裸子植物（Gymnosperms）与被子植物（Angiosperms）。 模拟研究补充文件包（SI Simulation Study Files.zip）：包含系统发育树（Phylograms）、合成数据集（Synthetic Data Sets）、BEAST2 XML文件、最大似然树（Maximum-Likelihood Trees）与贝叶斯树（Bayesian Trees），以及所有模拟条件下相关性检验的结果。 饱和度检验补充文件包（SI Saturation Tests.zip）：包含使用PhyloMAd（Dûchene et al. 2018）开展的饱和度检验结果。 子采样分析补充文件包（SI Sub-Sampling Files.zip）：包含被子植物（Angiosperms）子采样分析的序列联配（Alignments）、系统发育拓扑结构（Tree Topologies）、最大似然树（Maximum-Likelihood Trees）、贝叶斯树（Bayesian Trees），以及输出日志文件。方法与结果的完整细节详见补充材料（SI）。