Prochlorococcus marinus digital microbe
收藏资源简介:
This is the digital microbe describing the model organism Prochlorococcus marinus MIT 9301. The data includes: - (P_MARINUS_MIT9301-contigs.db) the complete genome sequence of P. marinus MIT 9301, along with NCBI PGAP gene annotations and automatically-generated annotations from NCBI COGs, KEGG KOfam/BRITE, Pfams, and anvi'o single-copy core gene sets. - (P_marinus_reproducible_workflow.md) a reproducible workflow describing how the database was generated.
本数据集为针对模式生物海洋原绿球菌(Prochlorococcus marinus)MIT 9301构建的数字微生物数据集。数据集包含以下内容: - (P_MARINUS_MIT9301-contigs.db) 海洋原绿球菌MIT 9301的完整基因组序列,附带NCBI原核生物基因组注释管道(NCBI PGAP)基因注释结果,以及来自NCBI同源基因簇(NCBI COGs)、京都基因与基因组百科全书(KEGG)KOfam/BRITE、蛋白质家族数据库(Pfam)以及anvi'o单拷贝核心基因集的自动注释结果。 - (P_marinus_reproducible_workflow.md) 一份可复现的工作流文档,详细阐述了该数据库的构建方法。



