Ovarian data used in CHETAH paper

This is the ovarian data set used in the CHETAH paper:<br> Kanter, Jurrian K. de, Philip Lijnzaad, Tito Candelli, Thanasis Margaritis, and Frank C. P. Holstege. “CHETAH: A Selective, Hierarchical Cell Type Identification Method for Single-Cell RNA Sequencing.” <i>Nucleic Acids Research</i>. Accessed July 1, 2019. https://doi.org/10.1093/nar/gkz543 <br>it was described in Schelker, Max, Sonia Feau, Jinyan Du, Nav Ranu, Edda Klipp, Gavin MacBeath, Birgit Schoeberl, and Andreas Raue. “Estimation of Immune Cell Content in Tumour Tissue Using Single-Cell RNA-Seq Data.” <i>Nature Communications</i> 8, no. 1 (December 11, 2017): 2032. https://doi.org/10.1038/s41467-017-02289-3<br>(but no longer available in figshare). <br>The Seurat 3 SingleCellExperiment format, consisting of <br> 25462 genes x 3114 cells of types with meta.data 'celltypes' distributed as<br> Unknown 125 CD4 T cell 323 CD8 T cell 31 reg. T cell 1 B cell 18 Macrophage 2057 Dendritic 114 NK 109 CAF 36 Tumor 300<br>For the other data in the CHETAH paper see https://figshare.com/s/aaf026376912366f81b6<br><br>

本数据集为CHETAH论文中使用的卵巢数据集：<br>Kanter, Jurrian K. de、Philip Lijnzaad、Tito Candelli、Thanasis Margaritis与Frank C. P. Holstege的《CHETAH：一种用于单细胞RNA测序的选择性分层细胞类型识别方法》，发表于《核酸研究（Nucleic Acids Research）》，2019年7月1日访问，DOI：10.1093/nar/gkz543。<br>该数据集的相关描述最早见于Schelker, Max、Sonia Feau、Jinyan Du、Nav Ranu、Edda Klipp、Gavin MacBeath、Birgit Schoeberl与Andreas Raue的《利用单细胞RNA测序数据估算肿瘤组织中的免疫细胞组分》，发表于《自然·通讯（Nature Communications）》第8卷第1期（2017年12月11日），页码2032，DOI：10.1038/s41467-017-02289-3。<br>（但该数据集现已无法在figshare平台获取。）<br>本数据集采用Seurat 3的单细胞实验对象格式（SingleCellExperiment），包含25462个基因×3114个细胞，附带元数据（meta.data）字段「celltypes」，其细胞类型分布如下：<br>未知细胞（Unknown）125个、CD4 T细胞323个、CD8 T细胞31个、调节性T细胞（reg. T cell）1个、B细胞18个、巨噬细胞2057个、树突状细胞（Dendritic）114个、NK细胞109个、癌症相关成纤维细胞（CAF）36个、肿瘤细胞300个。<br>如需获取CHETAH论文中的其他数据集，请访问：https://figshare.com/s/aaf026376912366f81b6