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Dataset S1 — In silico, in vitro and computational analyses of dietary protein hydrolysates as β-secretase inhibitors

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Zenodo2026-06-10 更新2026-06-12 收录
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Supplementary dataset for manuscript FOODCHEM-D-26-02928. Contains: Dataset_S1_BACE1.xlsx — 14 sheets covering:S1: Peptide library and IC50 valuesS2: FP screening frequencies for 15 hydrolysatesS3: Pearson correlation coefficientsS4: Degree of hydrolysis time courseS5–S7: IC50 raw data, summary, and fitting parametersS8–S9: Enzyme kinetics V0 data and kinetic parameters (Ki, Km, Vmax)S10: Molecular docking binding energies (16 peptides × 4 sites)S11: 800 ns MD simulation summary (8 systems)S12: MM-PBSA binding free energies (7 systems)S13: Steered MD PMF data (partial)S14: Lineweaver-Burk plot data PMF raw data files (GROMACS WHAM output):Control_pmf.xvg — PMF for BACE1 + QUD (no peptide)Control_bsResult.xvg — Bootstrap results for controlENY_S4_pmf.xvg — PMF for BACE1 + ENY at Site 4 + QUDENY_S4_bsResult.xvg — Bootstrap results for ENY_S4

本数据集为稿件FOODCHEM-D-26-02928的补充数据集,包含以下内容: Dataset_S1_BACE1.xlsx 共包含14个工作表,详情如下: S1:肽库与半最大抑制浓度(IC50)值 S2:15种水解物的荧光偏振(FP)筛选频率 S3:皮尔逊(Pearson)相关系数 S4:水解度时间进程数据 S5至S7:IC50原始数据、汇总结果与拟合参数 S8至S9:酶促动力学初速度(V0)数据及动力学参数(抑制常数Ki、米氏常数Km、最大反应速率Vmax) S10:分子对接结合能数据(16条肽段×4个结合位点) S11:8个体系的800 ns分子动力学(MD)模拟汇总结果 S12:7个体系的MM-PBSA结合自由能数据 S13:部分拉力分子动力学(Steered MD)的势能分布函数(PMF)数据 S14:莱因威弗-伯克(Lineweaver-Burk)作图数据 PMF原始数据文件(GROMACS WHAM 输出格式): Control_pmf.xvg:BACE1 + QUD(无肽段)体系的PMF Control_bsResult.xvg:对照组的自举(Bootstrap)结果 ENY_S4_pmf.xvg:BACE1 + 位点4 ENY肽段 + QUD体系的PMF ENY_S4_bsResult.xvg:ENY_S4体系的自举结果

提供机构:
Zenodo
创建时间:
2026-06-10
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