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SQLite database with MGI mouse gene annotations from Mouse Genome Informatics (MGI) at The Jackson Laboratory

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DataCite Commons2020-09-01 更新2024-07-25 收录
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资源简介:
A SQLite database with two tables: "description" and "genes". The description table includes the URL for the source file. The "genes" table contains the data, with 14 fields including chr (1-19, X, Y, MT), start and stop (in basepairs, GRCm38/mm10 build), source, strand, Name, and type.<br>This is like mouse_genes.sqlite, but just with the records with source=="MGI" and taking just one of each of the duplicate records for a gene.

本数据集为包含两张数据表的SQLite数据库,分别为"description"与"genes"。其中"description"表用于存储源文件的下载链接。 "genes"表为核心数据存储表,共包含14个字段,具体包括:染色体编号(chr,取值范围为1-19、X、Y、MT)、起始与终止位点(单位为碱基对,基于GRCm38/mm10基因组组装版本)、数据来源(source)、链(strand)、基因名称(Name)以及基因类型(type)。 该数据集与"mouse_genes.sqlite"类似,但仅保留数据来源(source)字段值为MGI(小鼠基因组信息数据库,Mouse Genome Informatics)的记录,且针对每条基因的重复记录仅保留唯一一条。
提供机构:
figshare
创建时间:
2017-11-13
5,000+
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54 个
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