Interrogating the diurnal transcriptome of the muscle autonomous clock in vivo

In this study, we used RNA sequencing to interrogate which aspects of circadian gene expression in skeletal muscle are autonomous or require clocks in other tissues Overall design: WT, KO and skeletal muscle Bmal1 reconstituted mice ( see Koronowski et al Cell 2019 and Greco et al Science Advances 2021 for general model description) were used to collect tissues at 6 time points over the diurnal cycle - 12 hr light: 12 hr dark conditions and ad libitum feeding of normal chow; tissues harvested at ZT0, 4, 8, 12, 16, 20

本研究采用RNA测序（RNA sequencing）技术，探究骨骼肌节律基因表达的哪些特征属于自主调控，或是依赖其他组织的生物钟调控。
实验设计：本研究使用野生型（Wild Type，WT）、敲除型（Knock Out，KO）以及骨骼肌Bmal1重组小鼠（具体模型构建细节详见Koronowski等发表于《Cell》2019年、Greco等发表于《Science Advances》2021年的研究），在昼夜周期内的6个时间点采集组织样本；实验采用12小时光照:12小时黑暗的光照条件，小鼠可自由摄食普通饲料；组织采集时间点为ZT0、4、8、12、16、20（ZT即授时因子时间（Zeitgeber Time））。