Codes for TopHat, HTSeqCount, DESeq2 and Plotly 3-D PCA
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The codes used for aligning the RNAseq reads to the mm10 mouse reference genome with TopHat v2.1.1, quantifying the read counts using HTSeqCount, comparison of the gene expression using DESeq2, and PCA analysis using Plotly 3-D PCA.
本代码用于以下生物信息学分析流程：使用TopHat v2.1.1将RNAseq读段比对至mm10小鼠参考基因组，使用HTSeqCount完成读段计数，使用DESeq2开展基因表达差异分析，以及使用Plotly进行三维主成分分析（PCA）。
创建时间：
2021-10-21
