Crystal structure of the SucA domain of Mycobacterium smegmatis KGD after soaking with succinylphosphonate phosphonoethyl ester, followed by temperature increase

Crystal structure of the SucA domain of Mycobacterium smegmatis KGD after soaking with succinylphosphonate phosphonoethyl ester, followed by temperature increase Descriptor: (4~{S})-4-[(2~{R})-3-[(4-azanyl-2-methyl-pyrimidin-5-yl)methyl]-4-methyl-5-[2-[oxidanyl(phosphonooxy)phosphoryl]oxyethyl]-2~{H}-1,3-thiazol-2-yl]-4-[ethoxy(oxidanyl)phosphoryl]-4-oxidanyl-butanoic acid, CALCIUM ION, MAGNESIUM ION, ... Authors: Wagner, T, Alzari, P.M, Bellinzoni, M. Deposit date: 2019-03-15 Release date: 2019-09-11 Last modified: 2024-01-24 Method: X-RAY DIFFRACTION (2.3 Å) Cite: Conformational transitions in the active site of mycobacterial 2-oxoglutarate dehydrogenase upon binding phosphonate analogues of 2-oxoglutarate: From a Michaelis-like complex to ThDP adducts. J.Struct.Biol., 208, 2019

耻垢分枝杆菌（Mycobacterium smegmatis）KGD的SucA结构域经琥珀酰膦酸膦酸乙酯浸泡后升温获得的晶体结构。配体信息：(4S)-4-[(2R)-3-[(4-氨基-2-甲基嘧啶-5-基)甲基]-4-甲基-5-[2-[羟基(膦酰氧基)膦酰基]氧基乙基]-2H-1,3-噻唑-2-基]-4-[乙氧基(羟基)膦酰基]-4-羟基丁酸、钙离子、镁离子及其他配体。作者：Wagner T、Alzari P.M.、Bellinzoni M.。沉积日期：2019年3月15日；发布日期：2019年9月11日；最后修改日期：2024年1月24日。实验方法：X射线衍射（X-RAY DIFFRACTION），分辨率2.3埃。引用文献：《分枝杆菌2-氧代戊二酸脱氢酶活性位点结合2-氧代戊二酸膦酸类似物后的构象转变：从类米氏复合物到硫胺素焦磷酸（ThDP）加合物》，《结构生物学杂志》（J. Struct. Biol.），208卷，2019年。