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Supplementary_data_Current status of global conservation and characterisation of wild and cultivated Brassicaceae genetic resources

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Figshare2024-04-10 更新2026-04-08 收录
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https://figshare.com/articles/dataset/Supplmentary_data_Current_status_of_global_conservation_and_characterisation_of_wild_and_cultivated_Brassicaceae_genetic_resources_a_gap_analysis/25002656/5
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This data is used in the article: <b>Castillo-Lorenzo, Breman, Gomez Barreiro and Viruel (2024). </b><b>Current status of global conservation and characterisation of wild and cultivated Brassicaceae genetic resources. </b><b><i>GigaScience </i></b><b>(</b><b><i>under review</i></b><b>)</b>Data gathered for 1242 wild Brassicaeea species related to cultivated species. The data includes conservation status, ex situ conservation records, classification of crop wild relatives and crop related to, phyisio and phenotipic traits described and published and chromosome number.The information was gathered from World Checklist of Vascular Plants (https://powo.science.kew.org/); USDA-GRIN Global (https://npgsweb.ars-grin.gov/gringlobal/taxon/taxonomysearchcwr); TRY plant trait database (https://www.try-db.org/TryWeb/dp.php); Harlan and De Wet CWR inventory (https://www.cwrdiversity.org/checklist); Genesys-pgr (https://www.genesys-pgr.org); NCBI (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/); Wild Germplasm of Brassica (Part II: Chromosome number, Warwick et al., 2009); Brassibase (https://brassibase.cos.uni-heidelberg.de/?action=cyto); the Plant DNA C-values database (https://cvalues.science.kew.org/) and plant CCDB database (https://taux.evolseq.net/CCDB_web). Conservation status was obtained from IUCN red list (https://www.iucnredlist.org/) and ThreatSearch tool from the BGCI (https://members.bgci.org/data_tools/threatsearch).(databases accessed between September and December 2022).

本数据集用于以下论文:<b>Castillo-Lorenzo、Breman、Gomez Barreiro 与 Viruel (2024)</b>——<b>《全球野生与栽培十字花科(Brassicaceae)遗传资源的保护现状与特征描述》</b>,发表于<b><i>GigaScience</i></b><b>(</b><b><i>待审稿</i></b><b>)</b>。 本数据集共收集了1242种与栽培物种相关的野生十字花科物种数据,涵盖保护现状、迁地保护记录、作物野生近缘种及相关作物的分类、已发表的生理与表型性状信息,以及染色体数目。 本数据集的信息源自以下数据库与文献: 1. 全球维管植物名录(World Checklist of Vascular Plants,https://powo.science.kew.org/) 2. 美国农业部农业研究服务局全球种质资源信息网络(USDA-GRIN Global,https://npgsweb.ars-grin.gov/gringlobal/taxon/taxonomysearchcwr) 3. TRY植物性状数据库(TRY plant trait database,https://www.try-db.org/TryWeb/dp.php) 4. Harlan与De Wet作物野生近缘种名录(Harlan and De Wet CWR inventory,https://www.cwrdiversity.org/checklist) 5. Genesys-pgr种质资源数据库(Genesys-pgr,https://www.genesys-pgr.org/) 6. 美国国家生物技术信息中心(NCBI,https://www.ncbi.nlm.nih.gov/) 7. 《十字花科野生种质资源(第二部分:染色体数目)》(Warwick等,2009) 8. Brassibase数据库(https://brassibase.cos.uni-heidelberg.de/?action=cyto) 9. 植物DNA C值数据库(Plant DNA C-values database,https://cvalues.science.kew.org/) 10. 植物染色体计数数据库(plant CCDB database,https://taux.evolseq.net/CCDB_web) 其中物种保护现状数据源自国际自然保护联盟红色名录(IUCN red list,https://www.iucnredlist.org/)以及国际植物园保护联盟(BGCI)的ThreatSearch工具(https://members.bgci.org/data_tools/threatsearch)。本数据集涉及的数据库检索工作均于2022年9月至12月期间完成。
提供机构:
Breman, Elinor; Castillo-Lorenzo, Elena; Viruel, Juan; Gomez Barreiro, Pablo
创建时间:
2024-04-10
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